Protein–RNA interactions for Protein: P31041

Cd28, T-cell-specific surface glycoprotein CD28, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd28P31041 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Cd28P31041 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cd28P31041 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cd28P31041 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cd28P31041 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Cd28P31041 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cd28P31041 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cd28P31041 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Cd28P31041 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Cd28P31041 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Cd28P31041 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cd28P31041 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cd28P31041 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cd28P31041 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cd28P31041 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cd28P31041 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cd28P31041 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cd28P31041 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cd28P31041 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cd28P31041 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cd28P31041 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cd28P31041 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cd28P31041 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Cd28P31041 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cd28P31041 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Cd28P31041 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Cd28P31041 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Cd28P31041 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cd28P31041 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Cd28P31041 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cd28P31041 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cd28P31041 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cd28P31041 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cd28P31041 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cd28P31041 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cd28P31041 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Cd28P31041 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cd28P31041 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cd28P31041 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cd28P31041 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cd28P31041 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cd28P31041 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cd28P31041 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cd28P31041 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cd28P31041 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cd28P31041 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cd28P31041 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Cd28P31041 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cd28P31041 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cd28P31041 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cd28P31041 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cd28P31041 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cd28P31041 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cd28P31041 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cd28P31041 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cd28P31041 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cd28P31041 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cd28P31041 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cd28P31041 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cd28P31041 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cd28P31041 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cd28P31041 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cd28P31041 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cd28P31041 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cd28P31041 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cd28P31041 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cd28P31041 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cd28P31041 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cd28P31041 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cd28P31041 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cd28P31041 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cd28P31041 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cd28P31041 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cd28P31041 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cd28P31041 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cd28P31041 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cd28P31041 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cd28P31041 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cd28P31041 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cd28P31041 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Cd28P31041 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cd28P31041 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cd28P31041 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cd28P31041 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cd28P31041 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cd28P31041 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cd28P31041 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Cd28P31041 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cd28P31041 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cd28P31041 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Cd28P31041 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cd28P31041 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cd28P31041 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cd28P31041 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cd28P31041 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Cd28P31041 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cd28P31041 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Cd28P31041 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cd28P31041 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cd28P31041 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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