Protein–RNA interactions for Protein: P29416

Hexa, Beta-hexosaminidase subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HexaP29416 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HexaP29416 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HexaP29416 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
HexaP29416 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HexaP29416 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HexaP29416 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HexaP29416 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HexaP29416 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
HexaP29416 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HexaP29416 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HexaP29416 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HexaP29416 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
HexaP29416 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
HexaP29416 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
HexaP29416 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
HexaP29416 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
HexaP29416 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HexaP29416 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HexaP29416 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HexaP29416 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HexaP29416 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HexaP29416 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HexaP29416 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HexaP29416 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HexaP29416 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
HexaP29416 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
HexaP29416 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
HexaP29416 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HexaP29416 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HexaP29416 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HexaP29416 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HexaP29416 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HexaP29416 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HexaP29416 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HexaP29416 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HexaP29416 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HexaP29416 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HexaP29416 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HexaP29416 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HexaP29416 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HexaP29416 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HexaP29416 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HexaP29416 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HexaP29416 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HexaP29416 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HexaP29416 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HexaP29416 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HexaP29416 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
HexaP29416 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
HexaP29416 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HexaP29416 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HexaP29416 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HexaP29416 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HexaP29416 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HexaP29416 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HexaP29416 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HexaP29416 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HexaP29416 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HexaP29416 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HexaP29416 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HexaP29416 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HexaP29416 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HexaP29416 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HexaP29416 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
HexaP29416 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HexaP29416 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HexaP29416 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HexaP29416 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HexaP29416 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HexaP29416 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HexaP29416 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HexaP29416 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HexaP29416 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HexaP29416 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HexaP29416 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HexaP29416 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HexaP29416 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HexaP29416 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HexaP29416 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HexaP29416 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HexaP29416 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
HexaP29416 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HexaP29416 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HexaP29416 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HexaP29416 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HexaP29416 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
HexaP29416 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
HexaP29416 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HexaP29416 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HexaP29416 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
HexaP29416 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HexaP29416 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HexaP29416 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HexaP29416 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HexaP29416 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HexaP29416 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HexaP29416 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HexaP29416 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HexaP29416 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HexaP29416 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms