Protein–RNA interactions for Protein: P29341

Pabpc1, Polyadenylate-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc1P29341 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pabpc1P29341 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pabpc1P29341 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pabpc1P29341 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pabpc1P29341 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pabpc1P29341 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pabpc1P29341 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pabpc1P29341 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pabpc1P29341 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pabpc1P29341 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Pabpc1P29341 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pabpc1P29341 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pabpc1P29341 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pabpc1P29341 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pabpc1P29341 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pabpc1P29341 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pabpc1P29341 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pabpc1P29341 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pabpc1P29341 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pabpc1P29341 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pabpc1P29341 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pabpc1P29341 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pabpc1P29341 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pabpc1P29341 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pabpc1P29341 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pabpc1P29341 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pabpc1P29341 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pabpc1P29341 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pabpc1P29341 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pabpc1P29341 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pabpc1P29341 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pabpc1P29341 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pabpc1P29341 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pabpc1P29341 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pabpc1P29341 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pabpc1P29341 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pabpc1P29341 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pabpc1P29341 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pabpc1P29341 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pabpc1P29341 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pabpc1P29341 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pabpc1P29341 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pabpc1P29341 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pabpc1P29341 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pabpc1P29341 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Pabpc1P29341 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pabpc1P29341 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pabpc1P29341 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pabpc1P29341 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pabpc1P29341 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Pabpc1P29341 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pabpc1P29341 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pabpc1P29341 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pabpc1P29341 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pabpc1P29341 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pabpc1P29341 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pabpc1P29341 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pabpc1P29341 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pabpc1P29341 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pabpc1P29341 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pabpc1P29341 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pabpc1P29341 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pabpc1P29341 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pabpc1P29341 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pabpc1P29341 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pabpc1P29341 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pabpc1P29341 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pabpc1P29341 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pabpc1P29341 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pabpc1P29341 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Pabpc1P29341 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pabpc1P29341 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pabpc1P29341 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pabpc1P29341 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pabpc1P29341 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pabpc1P29341 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pabpc1P29341 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pabpc1P29341 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pabpc1P29341 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pabpc1P29341 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pabpc1P29341 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pabpc1P29341 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pabpc1P29341 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Pabpc1P29341 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Pabpc1P29341 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pabpc1P29341 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pabpc1P29341 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Pabpc1P29341 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pabpc1P29341 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Pabpc1P29341 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
Pabpc1P29341 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Pabpc1P29341 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Pabpc1P29341 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Pabpc1P29341 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Pabpc1P29341 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Pabpc1P29341 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pabpc1P29341 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pabpc1P29341 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Pabpc1P29341 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pabpc1P29341 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms