Protein–RNA interactions for Protein: P27790

Cenpb, Major centromere autoantigen B, mousemouse

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CenpbP27790 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CenpbP27790 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CenpbP27790 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CenpbP27790 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CenpbP27790 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CenpbP27790 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CenpbP27790 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CenpbP27790 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CenpbP27790 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CenpbP27790 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CenpbP27790 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CenpbP27790 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CenpbP27790 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CenpbP27790 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CenpbP27790 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CenpbP27790 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CenpbP27790 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CenpbP27790 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CenpbP27790 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CenpbP27790 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CenpbP27790 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CenpbP27790 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CenpbP27790 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CenpbP27790 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CenpbP27790 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CenpbP27790 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CenpbP27790 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CenpbP27790 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CenpbP27790 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CenpbP27790 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CenpbP27790 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CenpbP27790 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
CenpbP27790 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
CenpbP27790 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.27
CenpbP27790 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
CenpbP27790 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CenpbP27790 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CenpbP27790 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CenpbP27790 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CenpbP27790 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CenpbP27790 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CenpbP27790 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CenpbP27790 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CenpbP27790 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CenpbP27790 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CenpbP27790 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CenpbP27790 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CenpbP27790 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CenpbP27790 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CenpbP27790 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CenpbP27790 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CenpbP27790 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CenpbP27790 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CenpbP27790 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CenpbP27790 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CenpbP27790 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CenpbP27790 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CenpbP27790 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CenpbP27790 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CenpbP27790 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CenpbP27790 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CenpbP27790 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CenpbP27790 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CenpbP27790 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CenpbP27790 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CenpbP27790 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CenpbP27790 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CenpbP27790 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CenpbP27790 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CenpbP27790 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CenpbP27790 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CenpbP27790 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CenpbP27790 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CenpbP27790 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CenpbP27790 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CenpbP27790 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CenpbP27790 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CenpbP27790 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CenpbP27790 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CenpbP27790 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CenpbP27790 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CenpbP27790 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CenpbP27790 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CenpbP27790 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CenpbP27790 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CenpbP27790 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CenpbP27790 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CenpbP27790 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CenpbP27790 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CenpbP27790 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CenpbP27790 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CenpbP27790 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CenpbP27790 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CenpbP27790 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CenpbP27790 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CenpbP27790 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CenpbP27790 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CenpbP27790 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CenpbP27790 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CenpbP27790 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms