Protein–RNA interactions for Protein: P26618

Pdgfra, Platelet-derived growth factor receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfraP26618 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
PdgfraP26618 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PdgfraP26618 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PdgfraP26618 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PdgfraP26618 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PdgfraP26618 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PdgfraP26618 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PdgfraP26618 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PdgfraP26618 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PdgfraP26618 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PdgfraP26618 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PdgfraP26618 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
PdgfraP26618 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PdgfraP26618 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PdgfraP26618 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PdgfraP26618 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PdgfraP26618 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PdgfraP26618 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
PdgfraP26618 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PdgfraP26618 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PdgfraP26618 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PdgfraP26618 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PdgfraP26618 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PdgfraP26618 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PdgfraP26618 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PdgfraP26618 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PdgfraP26618 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PdgfraP26618 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
PdgfraP26618 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
PdgfraP26618 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
PdgfraP26618 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PdgfraP26618 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PdgfraP26618 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PdgfraP26618 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PdgfraP26618 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PdgfraP26618 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PdgfraP26618 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PdgfraP26618 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PdgfraP26618 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PdgfraP26618 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PdgfraP26618 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PdgfraP26618 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PdgfraP26618 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PdgfraP26618 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PdgfraP26618 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PdgfraP26618 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PdgfraP26618 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PdgfraP26618 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PdgfraP26618 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PdgfraP26618 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PdgfraP26618 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PdgfraP26618 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PdgfraP26618 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PdgfraP26618 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PdgfraP26618 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
PdgfraP26618 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PdgfraP26618 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PdgfraP26618 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PdgfraP26618 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PdgfraP26618 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PdgfraP26618 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
PdgfraP26618 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PdgfraP26618 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PdgfraP26618 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PdgfraP26618 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PdgfraP26618 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PdgfraP26618 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PdgfraP26618 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PdgfraP26618 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PdgfraP26618 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PdgfraP26618 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PdgfraP26618 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PdgfraP26618 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PdgfraP26618 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PdgfraP26618 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PdgfraP26618 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PdgfraP26618 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PdgfraP26618 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PdgfraP26618 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PdgfraP26618 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
PdgfraP26618 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PdgfraP26618 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PdgfraP26618 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PdgfraP26618 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PdgfraP26618 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PdgfraP26618 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PdgfraP26618 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PdgfraP26618 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PdgfraP26618 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
PdgfraP26618 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PdgfraP26618 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PdgfraP26618 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PdgfraP26618 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PdgfraP26618 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PdgfraP26618 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PdgfraP26618 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PdgfraP26618 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PdgfraP26618 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PdgfraP26618 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PdgfraP26618 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms