Protein–RNA interactions for Protein: P26361

Cftr, Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator, mousemouse

Predictions only

Length 1,476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CftrP26361 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CftrP26361 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CftrP26361 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CftrP26361 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CftrP26361 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CftrP26361 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
CftrP26361 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CftrP26361 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CftrP26361 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CftrP26361 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CftrP26361 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
CftrP26361 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CftrP26361 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CftrP26361 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
CftrP26361 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CftrP26361 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CftrP26361 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CftrP26361 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CftrP26361 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
CftrP26361 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CftrP26361 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CftrP26361 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CftrP26361 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CftrP26361 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CftrP26361 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CftrP26361 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CftrP26361 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
CftrP26361 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CftrP26361 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CftrP26361 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CftrP26361 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CftrP26361 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CftrP26361 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CftrP26361 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CftrP26361 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CftrP26361 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
CftrP26361 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CftrP26361 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CftrP26361 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CftrP26361 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CftrP26361 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CftrP26361 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CftrP26361 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CftrP26361 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CftrP26361 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CftrP26361 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CftrP26361 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CftrP26361 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CftrP26361 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CftrP26361 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
CftrP26361 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CftrP26361 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CftrP26361 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CftrP26361 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CftrP26361 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CftrP26361 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
CftrP26361 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CftrP26361 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CftrP26361 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CftrP26361 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CftrP26361 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CftrP26361 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CftrP26361 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CftrP26361 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CftrP26361 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CftrP26361 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CftrP26361 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CftrP26361 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CftrP26361 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
CftrP26361 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CftrP26361 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CftrP26361 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CftrP26361 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CftrP26361 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CftrP26361 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CftrP26361 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
CftrP26361 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CftrP26361 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CftrP26361 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CftrP26361 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CftrP26361 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CftrP26361 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CftrP26361 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CftrP26361 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CftrP26361 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CftrP26361 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CftrP26361 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CftrP26361 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CftrP26361 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CftrP26361 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CftrP26361 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CftrP26361 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CftrP26361 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CftrP26361 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CftrP26361 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CftrP26361 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CftrP26361 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
CftrP26361 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CftrP26361 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CftrP26361 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms