Protein–RNA interactions for Protein: P26339

Chga, Chromogranin-A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChgaP26339 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
ChgaP26339 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ChgaP26339 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ChgaP26339 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ChgaP26339 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ChgaP26339 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ChgaP26339 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ChgaP26339 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ChgaP26339 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ChgaP26339 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ChgaP26339 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ChgaP26339 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ChgaP26339 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ChgaP26339 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ChgaP26339 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ChgaP26339 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ChgaP26339 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ChgaP26339 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ChgaP26339 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ChgaP26339 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
ChgaP26339 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
ChgaP26339 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ChgaP26339 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ChgaP26339 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ChgaP26339 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ChgaP26339 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
ChgaP26339 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
ChgaP26339 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
ChgaP26339 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
ChgaP26339 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ChgaP26339 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ChgaP26339 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ChgaP26339 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ChgaP26339 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
ChgaP26339 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ChgaP26339 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ChgaP26339 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ChgaP26339 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ChgaP26339 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ChgaP26339 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ChgaP26339 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ChgaP26339 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ChgaP26339 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ChgaP26339 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ChgaP26339 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ChgaP26339 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ChgaP26339 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ChgaP26339 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ChgaP26339 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ChgaP26339 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ChgaP26339 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ChgaP26339 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ChgaP26339 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ChgaP26339 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC21■□□□□ 0.95
ChgaP26339 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ChgaP26339 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ChgaP26339 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
ChgaP26339 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ChgaP26339 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
ChgaP26339 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ChgaP26339 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ChgaP26339 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ChgaP26339 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ChgaP26339 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ChgaP26339 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ChgaP26339 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
ChgaP26339 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ChgaP26339 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ChgaP26339 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ChgaP26339 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
ChgaP26339 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ChgaP26339 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ChgaP26339 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ChgaP26339 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ChgaP26339 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ChgaP26339 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ChgaP26339 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ChgaP26339 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
ChgaP26339 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ChgaP26339 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ChgaP26339 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ChgaP26339 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ChgaP26339 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ChgaP26339 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ChgaP26339 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ChgaP26339 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ChgaP26339 Gm42790-201ENSMUST00000201268 969 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
ChgaP26339 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ChgaP26339 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ChgaP26339 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ChgaP26339 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ChgaP26339 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ChgaP26339 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ChgaP26339 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ChgaP26339 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ChgaP26339 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ChgaP26339 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
ChgaP26339 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ChgaP26339 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ChgaP26339 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms