Protein–RNA interactions for Protein: P25425

Pou2f1, POU domain, class 2, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 770 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou2f1P25425 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Pou2f1P25425 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pou2f1P25425 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pou2f1P25425 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Pou2f1P25425 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pou2f1P25425 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pou2f1P25425 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pou2f1P25425 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pou2f1P25425 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pou2f1P25425 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pou2f1P25425 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pou2f1P25425 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pou2f1P25425 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pou2f1P25425 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pou2f1P25425 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pou2f1P25425 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pou2f1P25425 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pou2f1P25425 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pou2f1P25425 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pou2f1P25425 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pou2f1P25425 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pou2f1P25425 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pou2f1P25425 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pou2f1P25425 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pou2f1P25425 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pou2f1P25425 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pou2f1P25425 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pou2f1P25425 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pou2f1P25425 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pou2f1P25425 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pou2f1P25425 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pou2f1P25425 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pou2f1P25425 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pou2f1P25425 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pou2f1P25425 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pou2f1P25425 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pou2f1P25425 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pou2f1P25425 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pou2f1P25425 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pou2f1P25425 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pou2f1P25425 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pou2f1P25425 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pou2f1P25425 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pou2f1P25425 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pou2f1P25425 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pou2f1P25425 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pou2f1P25425 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pou2f1P25425 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pou2f1P25425 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pou2f1P25425 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pou2f1P25425 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pou2f1P25425 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pou2f1P25425 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pou2f1P25425 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pou2f1P25425 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pou2f1P25425 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pou2f1P25425 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pou2f1P25425 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pou2f1P25425 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pou2f1P25425 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pou2f1P25425 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pou2f1P25425 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Pou2f1P25425 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Pou2f1P25425 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Pou2f1P25425 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Pou2f1P25425 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Pou2f1P25425 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Pou2f1P25425 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pou2f1P25425 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pou2f1P25425 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pou2f1P25425 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pou2f1P25425 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pou2f1P25425 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pou2f1P25425 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pou2f1P25425 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pou2f1P25425 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pou2f1P25425 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pou2f1P25425 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pou2f1P25425 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pou2f1P25425 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pou2f1P25425 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pou2f1P25425 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pou2f1P25425 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pou2f1P25425 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pou2f1P25425 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pou2f1P25425 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pou2f1P25425 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pou2f1P25425 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pou2f1P25425 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pou2f1P25425 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pou2f1P25425 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pou2f1P25425 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Pou2f1P25425 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pou2f1P25425 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pou2f1P25425 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pou2f1P25425 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pou2f1P25425 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pou2f1P25425 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pou2f1P25425 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pou2f1P25425 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms