Protein–RNA interactions for Protein: P24699

Myf5, Myogenic factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 255 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myf5P24699 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Myf5P24699 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Myf5P24699 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Myf5P24699 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Myf5P24699 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Myf5P24699 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Myf5P24699 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Myf5P24699 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Myf5P24699 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Myf5P24699 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Myf5P24699 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Myf5P24699 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Myf5P24699 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Myf5P24699 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Myf5P24699 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Myf5P24699 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Myf5P24699 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Myf5P24699 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Myf5P24699 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Myf5P24699 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Myf5P24699 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Myf5P24699 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Myf5P24699 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Myf5P24699 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Myf5P24699 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Myf5P24699 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Myf5P24699 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Myf5P24699 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Myf5P24699 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Myf5P24699 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Myf5P24699 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Myf5P24699 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Myf5P24699 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Myf5P24699 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Myf5P24699 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Myf5P24699 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Myf5P24699 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Myf5P24699 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Myf5P24699 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Myf5P24699 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Myf5P24699 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Myf5P24699 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Myf5P24699 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Myf5P24699 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Myf5P24699 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Myf5P24699 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Myf5P24699 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Myf5P24699 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Myf5P24699 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Myf5P24699 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Myf5P24699 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Myf5P24699 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Myf5P24699 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Myf5P24699 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Myf5P24699 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Myf5P24699 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Myf5P24699 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Myf5P24699 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Myf5P24699 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Myf5P24699 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Myf5P24699 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Myf5P24699 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Myf5P24699 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Myf5P24699 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Myf5P24699 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Myf5P24699 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Myf5P24699 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Myf5P24699 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Myf5P24699 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Myf5P24699 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Myf5P24699 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Myf5P24699 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Myf5P24699 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Myf5P24699 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Myf5P24699 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Myf5P24699 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Myf5P24699 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Myf5P24699 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Myf5P24699 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Myf5P24699 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Myf5P24699 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Myf5P24699 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Myf5P24699 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Myf5P24699 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Myf5P24699 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Myf5P24699 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Myf5P24699 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Myf5P24699 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Myf5P24699 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Myf5P24699 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Myf5P24699 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Myf5P24699 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Myf5P24699 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Myf5P24699 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Myf5P24699 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Myf5P24699 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Myf5P24699 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Myf5P24699 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Myf5P24699 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Myf5P24699 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.2 ms