Protein–RNA interactions for Protein: P23979

Htr3a, 5-hydroxytryptamine receptor 3A, mousemouse

Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htr3aP23979 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Htr3aP23979 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Htr3aP23979 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Htr3aP23979 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Htr3aP23979 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Htr3aP23979 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Htr3aP23979 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Htr3aP23979 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Htr3aP23979 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Htr3aP23979 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Htr3aP23979 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Htr3aP23979 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Htr3aP23979 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Htr3aP23979 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Htr3aP23979 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Htr3aP23979 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Htr3aP23979 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Htr3aP23979 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Htr3aP23979 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Htr3aP23979 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Htr3aP23979 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Htr3aP23979 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Htr3aP23979 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Htr3aP23979 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Htr3aP23979 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Htr3aP23979 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Htr3aP23979 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Htr3aP23979 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Htr3aP23979 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Htr3aP23979 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Htr3aP23979 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Htr3aP23979 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Htr3aP23979 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Htr3aP23979 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Htr3aP23979 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Htr3aP23979 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Htr3aP23979 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Htr3aP23979 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Htr3aP23979 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Htr3aP23979 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Htr3aP23979 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Htr3aP23979 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Htr3aP23979 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Htr3aP23979 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Htr3aP23979 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Htr3aP23979 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Htr3aP23979 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Htr3aP23979 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Htr3aP23979 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Htr3aP23979 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Htr3aP23979 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Htr3aP23979 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Htr3aP23979 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Htr3aP23979 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Htr3aP23979 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Htr3aP23979 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Htr3aP23979 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Htr3aP23979 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Htr3aP23979 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Htr3aP23979 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Htr3aP23979 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Htr3aP23979 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Htr3aP23979 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Htr3aP23979 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Htr3aP23979 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Htr3aP23979 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Htr3aP23979 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Htr3aP23979 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Htr3aP23979 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Htr3aP23979 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Htr3aP23979 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Htr3aP23979 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Htr3aP23979 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Htr3aP23979 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Htr3aP23979 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Htr3aP23979 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Htr3aP23979 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Htr3aP23979 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Htr3aP23979 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Htr3aP23979 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Htr3aP23979 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Htr3aP23979 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Htr3aP23979 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Htr3aP23979 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Htr3aP23979 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Htr3aP23979 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Htr3aP23979 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Htr3aP23979 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Htr3aP23979 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Htr3aP23979 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Htr3aP23979 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Htr3aP23979 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Htr3aP23979 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Htr3aP23979 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Htr3aP23979 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Htr3aP23979 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Htr3aP23979 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Htr3aP23979 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Htr3aP23979 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Htr3aP23979 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.9 ms