Protein–RNA interactions for Protein: P23812

Hoxd12, Homeobox protein Hox-D12, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd12P23812 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxd12P23812 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxd12P23812 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxd12P23812 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxd12P23812 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxd12P23812 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxd12P23812 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxd12P23812 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxd12P23812 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxd12P23812 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxd12P23812 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxd12P23812 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxd12P23812 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxd12P23812 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxd12P23812 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxd12P23812 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxd12P23812 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxd12P23812 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxd12P23812 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxd12P23812 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxd12P23812 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Hoxd12P23812 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hoxd12P23812 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hoxd12P23812 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hoxd12P23812 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hoxd12P23812 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hoxd12P23812 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hoxd12P23812 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hoxd12P23812 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Hoxd12P23812 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hoxd12P23812 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hoxd12P23812 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hoxd12P23812 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hoxd12P23812 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hoxd12P23812 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hoxd12P23812 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Hoxd12P23812 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Hoxd12P23812 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Hoxd12P23812 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Hoxd12P23812 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxd12P23812 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxd12P23812 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxd12P23812 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxd12P23812 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxd12P23812 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxd12P23812 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxd12P23812 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxd12P23812 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxd12P23812 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxd12P23812 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxd12P23812 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxd12P23812 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxd12P23812 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxd12P23812 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxd12P23812 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxd12P23812 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxd12P23812 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxd12P23812 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxd12P23812 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxd12P23812 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxd12P23812 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxd12P23812 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxd12P23812 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxd12P23812 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxd12P23812 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxd12P23812 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Hoxd12P23812 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxd12P23812 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxd12P23812 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxd12P23812 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxd12P23812 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxd12P23812 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Hoxd12P23812 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxd12P23812 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Hoxd12P23812 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxd12P23812 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxd12P23812 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxd12P23812 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxd12P23812 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxd12P23812 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxd12P23812 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxd12P23812 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxd12P23812 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxd12P23812 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxd12P23812 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxd12P23812 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxd12P23812 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxd12P23812 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxd12P23812 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxd12P23812 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxd12P23812 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxd12P23812 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxd12P23812 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxd12P23812 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxd12P23812 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxd12P23812 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxd12P23812 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxd12P23812 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxd12P23812 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxd12P23812 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms