Protein–RNA interactions for Protein: P23591

Tsta3, GDP-L-fucose synthase, mousemouse

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsta3P23591 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Tsta3P23591 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tsta3P23591 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tsta3P23591 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tsta3P23591 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tsta3P23591 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tsta3P23591 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tsta3P23591 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tsta3P23591 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tsta3P23591 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tsta3P23591 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tsta3P23591 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tsta3P23591 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tsta3P23591 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tsta3P23591 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tsta3P23591 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tsta3P23591 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tsta3P23591 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tsta3P23591 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tsta3P23591 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tsta3P23591 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tsta3P23591 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tsta3P23591 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tsta3P23591 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tsta3P23591 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tsta3P23591 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tsta3P23591 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tsta3P23591 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tsta3P23591 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tsta3P23591 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tsta3P23591 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tsta3P23591 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tsta3P23591 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tsta3P23591 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tsta3P23591 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tsta3P23591 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tsta3P23591 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tsta3P23591 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tsta3P23591 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tsta3P23591 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tsta3P23591 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tsta3P23591 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tsta3P23591 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tsta3P23591 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tsta3P23591 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tsta3P23591 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tsta3P23591 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tsta3P23591 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tsta3P23591 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tsta3P23591 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tsta3P23591 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tsta3P23591 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tsta3P23591 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tsta3P23591 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tsta3P23591 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Tsta3P23591 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tsta3P23591 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tsta3P23591 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tsta3P23591 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tsta3P23591 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tsta3P23591 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tsta3P23591 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tsta3P23591 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tsta3P23591 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tsta3P23591 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tsta3P23591 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tsta3P23591 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tsta3P23591 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tsta3P23591 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tsta3P23591 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tsta3P23591 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tsta3P23591 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Tsta3P23591 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tsta3P23591 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tsta3P23591 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tsta3P23591 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tsta3P23591 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tsta3P23591 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Tsta3P23591 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Tsta3P23591 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tsta3P23591 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tsta3P23591 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tsta3P23591 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tsta3P23591 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tsta3P23591 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tsta3P23591 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tsta3P23591 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tsta3P23591 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tsta3P23591 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tsta3P23591 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tsta3P23591 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tsta3P23591 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tsta3P23591 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tsta3P23591 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tsta3P23591 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tsta3P23591 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tsta3P23591 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tsta3P23591 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tsta3P23591 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Tsta3P23591 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms