Protein–RNA interactions for Protein: P23298

Prkch, Protein kinase C eta type, mousemouse

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Length 683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkchP23298 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PrkchP23298 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PrkchP23298 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PrkchP23298 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PrkchP23298 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PrkchP23298 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PrkchP23298 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PrkchP23298 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PrkchP23298 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PrkchP23298 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PrkchP23298 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PrkchP23298 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PrkchP23298 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PrkchP23298 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PrkchP23298 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
PrkchP23298 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PrkchP23298 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PrkchP23298 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PrkchP23298 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PrkchP23298 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PrkchP23298 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PrkchP23298 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PrkchP23298 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PrkchP23298 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PrkchP23298 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PrkchP23298 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PrkchP23298 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PrkchP23298 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PrkchP23298 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PrkchP23298 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PrkchP23298 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PrkchP23298 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PrkchP23298 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PrkchP23298 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PrkchP23298 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PrkchP23298 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PrkchP23298 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PrkchP23298 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PrkchP23298 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
PrkchP23298 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
PrkchP23298 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PrkchP23298 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PrkchP23298 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PrkchP23298 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PrkchP23298 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PrkchP23298 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PrkchP23298 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PrkchP23298 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PrkchP23298 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PrkchP23298 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PrkchP23298 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PrkchP23298 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
PrkchP23298 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PrkchP23298 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PrkchP23298 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PrkchP23298 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PrkchP23298 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PrkchP23298 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PrkchP23298 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PrkchP23298 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PrkchP23298 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PrkchP23298 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PrkchP23298 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PrkchP23298 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PrkchP23298 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PrkchP23298 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PrkchP23298 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PrkchP23298 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
PrkchP23298 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PrkchP23298 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PrkchP23298 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PrkchP23298 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PrkchP23298 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PrkchP23298 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PrkchP23298 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PrkchP23298 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PrkchP23298 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PrkchP23298 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PrkchP23298 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PrkchP23298 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PrkchP23298 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PrkchP23298 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PrkchP23298 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PrkchP23298 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PrkchP23298 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PrkchP23298 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PrkchP23298 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PrkchP23298 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PrkchP23298 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PrkchP23298 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PrkchP23298 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PrkchP23298 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PrkchP23298 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PrkchP23298 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PrkchP23298 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PrkchP23298 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
PrkchP23298 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PrkchP23298 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PrkchP23298 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PrkchP23298 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
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