Protein–RNA interactions for Protein: P21952

Pou3f1, POU domain, class 3, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou3f1P21952 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pou3f1P21952 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pou3f1P21952 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pou3f1P21952 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pou3f1P21952 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pou3f1P21952 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pou3f1P21952 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pou3f1P21952 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pou3f1P21952 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pou3f1P21952 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pou3f1P21952 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pou3f1P21952 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pou3f1P21952 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pou3f1P21952 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pou3f1P21952 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pou3f1P21952 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pou3f1P21952 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Pou3f1P21952 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pou3f1P21952 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pou3f1P21952 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pou3f1P21952 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pou3f1P21952 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pou3f1P21952 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pou3f1P21952 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pou3f1P21952 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pou3f1P21952 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pou3f1P21952 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pou3f1P21952 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pou3f1P21952 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pou3f1P21952 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Pou3f1P21952 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pou3f1P21952 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Pou3f1P21952 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pou3f1P21952 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pou3f1P21952 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pou3f1P21952 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pou3f1P21952 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pou3f1P21952 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pou3f1P21952 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pou3f1P21952 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pou3f1P21952 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pou3f1P21952 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Pou3f1P21952 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pou3f1P21952 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pou3f1P21952 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pou3f1P21952 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pou3f1P21952 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pou3f1P21952 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Pou3f1P21952 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pou3f1P21952 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pou3f1P21952 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pou3f1P21952 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pou3f1P21952 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pou3f1P21952 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pou3f1P21952 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pou3f1P21952 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pou3f1P21952 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pou3f1P21952 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pou3f1P21952 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pou3f1P21952 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pou3f1P21952 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pou3f1P21952 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pou3f1P21952 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pou3f1P21952 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pou3f1P21952 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pou3f1P21952 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pou3f1P21952 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pou3f1P21952 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Pou3f1P21952 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pou3f1P21952 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pou3f1P21952 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pou3f1P21952 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pou3f1P21952 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pou3f1P21952 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pou3f1P21952 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pou3f1P21952 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pou3f1P21952 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Pou3f1P21952 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pou3f1P21952 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pou3f1P21952 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pou3f1P21952 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pou3f1P21952 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pou3f1P21952 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pou3f1P21952 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pou3f1P21952 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pou3f1P21952 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pou3f1P21952 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pou3f1P21952 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pou3f1P21952 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pou3f1P21952 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pou3f1P21952 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pou3f1P21952 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pou3f1P21952 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pou3f1P21952 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pou3f1P21952 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pou3f1P21952 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pou3f1P21952 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pou3f1P21952 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pou3f1P21952 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pou3f1P21952 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms