Protein–RNA interactions for Protein: P21761

Trhr, Thyrotropin-releasing hormone receptor, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrhrP21761 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TrhrP21761 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TrhrP21761 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TrhrP21761 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TrhrP21761 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TrhrP21761 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TrhrP21761 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TrhrP21761 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TrhrP21761 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TrhrP21761 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TrhrP21761 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TrhrP21761 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TrhrP21761 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TrhrP21761 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TrhrP21761 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TrhrP21761 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TrhrP21761 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TrhrP21761 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TrhrP21761 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TrhrP21761 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TrhrP21761 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TrhrP21761 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TrhrP21761 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TrhrP21761 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TrhrP21761 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TrhrP21761 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TrhrP21761 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TrhrP21761 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TrhrP21761 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TrhrP21761 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TrhrP21761 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TrhrP21761 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TrhrP21761 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TrhrP21761 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TrhrP21761 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TrhrP21761 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TrhrP21761 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TrhrP21761 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TrhrP21761 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TrhrP21761 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TrhrP21761 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TrhrP21761 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TrhrP21761 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TrhrP21761 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TrhrP21761 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TrhrP21761 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TrhrP21761 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TrhrP21761 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TrhrP21761 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TrhrP21761 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TrhrP21761 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TrhrP21761 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TrhrP21761 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TrhrP21761 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TrhrP21761 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TrhrP21761 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TrhrP21761 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TrhrP21761 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TrhrP21761 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TrhrP21761 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TrhrP21761 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TrhrP21761 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TrhrP21761 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TrhrP21761 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TrhrP21761 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TrhrP21761 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TrhrP21761 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TrhrP21761 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TrhrP21761 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TrhrP21761 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TrhrP21761 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TrhrP21761 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
TrhrP21761 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TrhrP21761 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TrhrP21761 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TrhrP21761 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TrhrP21761 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TrhrP21761 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TrhrP21761 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TrhrP21761 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TrhrP21761 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TrhrP21761 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TrhrP21761 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TrhrP21761 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TrhrP21761 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TrhrP21761 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TrhrP21761 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
TrhrP21761 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TrhrP21761 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TrhrP21761 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TrhrP21761 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TrhrP21761 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TrhrP21761 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TrhrP21761 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TrhrP21761 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TrhrP21761 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TrhrP21761 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TrhrP21761 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TrhrP21761 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TrhrP21761 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms