Protein–RNA interactions for Protein: P20801

Tnnc2, Troponin C, skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnc2P20801 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tnnc2P20801 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Tnnc2P20801 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tnnc2P20801 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tnnc2P20801 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tnnc2P20801 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tnnc2P20801 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tnnc2P20801 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tnnc2P20801 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tnnc2P20801 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tnnc2P20801 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tnnc2P20801 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tnnc2P20801 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tnnc2P20801 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tnnc2P20801 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tnnc2P20801 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tnnc2P20801 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tnnc2P20801 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tnnc2P20801 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tnnc2P20801 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tnnc2P20801 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tnnc2P20801 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tnnc2P20801 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Tnnc2P20801 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tnnc2P20801 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tnnc2P20801 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tnnc2P20801 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tnnc2P20801 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tnnc2P20801 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tnnc2P20801 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tnnc2P20801 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tnnc2P20801 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tnnc2P20801 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tnnc2P20801 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tnnc2P20801 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tnnc2P20801 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tnnc2P20801 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tnnc2P20801 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tnnc2P20801 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tnnc2P20801 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tnnc2P20801 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tnnc2P20801 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tnnc2P20801 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tnnc2P20801 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tnnc2P20801 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tnnc2P20801 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tnnc2P20801 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tnnc2P20801 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tnnc2P20801 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tnnc2P20801 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tnnc2P20801 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tnnc2P20801 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tnnc2P20801 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tnnc2P20801 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tnnc2P20801 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tnnc2P20801 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tnnc2P20801 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tnnc2P20801 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tnnc2P20801 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Tnnc2P20801 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Tnnc2P20801 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tnnc2P20801 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tnnc2P20801 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tnnc2P20801 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tnnc2P20801 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Tnnc2P20801 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tnnc2P20801 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tnnc2P20801 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tnnc2P20801 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tnnc2P20801 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tnnc2P20801 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tnnc2P20801 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tnnc2P20801 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tnnc2P20801 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tnnc2P20801 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tnnc2P20801 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tnnc2P20801 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tnnc2P20801 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tnnc2P20801 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tnnc2P20801 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tnnc2P20801 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Tnnc2P20801 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tnnc2P20801 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tnnc2P20801 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tnnc2P20801 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tnnc2P20801 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tnnc2P20801 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tnnc2P20801 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tnnc2P20801 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tnnc2P20801 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tnnc2P20801 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tnnc2P20801 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tnnc2P20801 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tnnc2P20801 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tnnc2P20801 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tnnc2P20801 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tnnc2P20801 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tnnc2P20801 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tnnc2P20801 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tnnc2P20801 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms