Protein–RNA interactions for Protein: P20664

Prim1, DNA primase small subunit, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prim1P20664 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Prim1P20664 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Prim1P20664 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Prim1P20664 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Prim1P20664 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Prim1P20664 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Prim1P20664 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Prim1P20664 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Prim1P20664 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Prim1P20664 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Prim1P20664 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Prim1P20664 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Prim1P20664 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Prim1P20664 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Prim1P20664 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Prim1P20664 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Prim1P20664 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Prim1P20664 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Prim1P20664 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Prim1P20664 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Prim1P20664 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Prim1P20664 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Prim1P20664 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Prim1P20664 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Prim1P20664 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Prim1P20664 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Prim1P20664 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Prim1P20664 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Prim1P20664 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Prim1P20664 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Prim1P20664 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Prim1P20664 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Prim1P20664 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Prim1P20664 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Prim1P20664 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Prim1P20664 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Prim1P20664 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Prim1P20664 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Prim1P20664 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Prim1P20664 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Prim1P20664 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Prim1P20664 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Prim1P20664 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Prim1P20664 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Prim1P20664 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Prim1P20664 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Prim1P20664 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Prim1P20664 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Prim1P20664 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Prim1P20664 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Prim1P20664 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Prim1P20664 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Prim1P20664 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Prim1P20664 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Prim1P20664 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Prim1P20664 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Prim1P20664 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Prim1P20664 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Prim1P20664 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Prim1P20664 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Prim1P20664 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Prim1P20664 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Prim1P20664 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Prim1P20664 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Prim1P20664 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Prim1P20664 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Prim1P20664 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Prim1P20664 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Prim1P20664 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Prim1P20664 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Prim1P20664 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Prim1P20664 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Prim1P20664 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Prim1P20664 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Prim1P20664 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Prim1P20664 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Prim1P20664 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Prim1P20664 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Prim1P20664 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Prim1P20664 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Prim1P20664 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Prim1P20664 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Prim1P20664 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Prim1P20664 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Prim1P20664 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Prim1P20664 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Prim1P20664 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Prim1P20664 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Prim1P20664 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Prim1P20664 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Prim1P20664 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Prim1P20664 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Prim1P20664 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Prim1P20664 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Prim1P20664 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Prim1P20664 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Prim1P20664 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Prim1P20664 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Prim1P20664 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Prim1P20664 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms