Protein–RNA interactions for Protein: P20490

Ms4a2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a2P20490 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ms4a2P20490 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Ms4a2P20490 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Ms4a2P20490 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Ms4a2P20490 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Ms4a2P20490 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ms4a2P20490 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Ms4a2P20490 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Ms4a2P20490 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ms4a2P20490 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ms4a2P20490 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Ms4a2P20490 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ms4a2P20490 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ms4a2P20490 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ms4a2P20490 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ms4a2P20490 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ms4a2P20490 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ms4a2P20490 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ms4a2P20490 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ms4a2P20490 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ms4a2P20490 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ms4a2P20490 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ms4a2P20490 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ms4a2P20490 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ms4a2P20490 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ms4a2P20490 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ms4a2P20490 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ms4a2P20490 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ms4a2P20490 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ms4a2P20490 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ms4a2P20490 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ms4a2P20490 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ms4a2P20490 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ms4a2P20490 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ms4a2P20490 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ms4a2P20490 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ms4a2P20490 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ms4a2P20490 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ms4a2P20490 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ms4a2P20490 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ms4a2P20490 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ms4a2P20490 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ms4a2P20490 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ms4a2P20490 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ms4a2P20490 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ms4a2P20490 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Ms4a2P20490 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ms4a2P20490 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ms4a2P20490 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ms4a2P20490 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ms4a2P20490 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ms4a2P20490 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ms4a2P20490 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ms4a2P20490 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ms4a2P20490 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ms4a2P20490 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ms4a2P20490 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ms4a2P20490 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ms4a2P20490 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ms4a2P20490 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ms4a2P20490 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ms4a2P20490 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ms4a2P20490 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ms4a2P20490 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ms4a2P20490 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ms4a2P20490 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ms4a2P20490 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ms4a2P20490 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ms4a2P20490 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ms4a2P20490 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ms4a2P20490 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ms4a2P20490 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ms4a2P20490 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ms4a2P20490 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ms4a2P20490 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ms4a2P20490 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ms4a2P20490 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Ms4a2P20490 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ms4a2P20490 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ms4a2P20490 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ms4a2P20490 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ms4a2P20490 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ms4a2P20490 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ms4a2P20490 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ms4a2P20490 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Ms4a2P20490 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ms4a2P20490 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ms4a2P20490 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Ms4a2P20490 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ms4a2P20490 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ms4a2P20490 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ms4a2P20490 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ms4a2P20490 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ms4a2P20490 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ms4a2P20490 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ms4a2P20490 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ms4a2P20490 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ms4a2P20490 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ms4a2P20490 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ms4a2P20490 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms