Protein–RNA interactions for Protein: P19783

Cox4i1, Cytochrome c oxidase subunit 4 isoform 1, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cox4i1P19783 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cox4i1P19783 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Cox4i1P19783 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cox4i1P19783 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cox4i1P19783 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cox4i1P19783 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cox4i1P19783 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cox4i1P19783 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cox4i1P19783 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cox4i1P19783 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cox4i1P19783 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Cox4i1P19783 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cox4i1P19783 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cox4i1P19783 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cox4i1P19783 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cox4i1P19783 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cox4i1P19783 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cox4i1P19783 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cox4i1P19783 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cox4i1P19783 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cox4i1P19783 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cox4i1P19783 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cox4i1P19783 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cox4i1P19783 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cox4i1P19783 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cox4i1P19783 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cox4i1P19783 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cox4i1P19783 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cox4i1P19783 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cox4i1P19783 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cox4i1P19783 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cox4i1P19783 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cox4i1P19783 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cox4i1P19783 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cox4i1P19783 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cox4i1P19783 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cox4i1P19783 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cox4i1P19783 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cox4i1P19783 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cox4i1P19783 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cox4i1P19783 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cox4i1P19783 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cox4i1P19783 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cox4i1P19783 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cox4i1P19783 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cox4i1P19783 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cox4i1P19783 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cox4i1P19783 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cox4i1P19783 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cox4i1P19783 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cox4i1P19783 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cox4i1P19783 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cox4i1P19783 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cox4i1P19783 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cox4i1P19783 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cox4i1P19783 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cox4i1P19783 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cox4i1P19783 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cox4i1P19783 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cox4i1P19783 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cox4i1P19783 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cox4i1P19783 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cox4i1P19783 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cox4i1P19783 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cox4i1P19783 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cox4i1P19783 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cox4i1P19783 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cox4i1P19783 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cox4i1P19783 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Cox4i1P19783 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cox4i1P19783 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cox4i1P19783 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cox4i1P19783 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cox4i1P19783 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cox4i1P19783 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cox4i1P19783 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cox4i1P19783 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cox4i1P19783 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cox4i1P19783 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cox4i1P19783 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Cox4i1P19783 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cox4i1P19783 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cox4i1P19783 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cox4i1P19783 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cox4i1P19783 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cox4i1P19783 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cox4i1P19783 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cox4i1P19783 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cox4i1P19783 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cox4i1P19783 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cox4i1P19783 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cox4i1P19783 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cox4i1P19783 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cox4i1P19783 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cox4i1P19783 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cox4i1P19783 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cox4i1P19783 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Cox4i1P19783 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Cox4i1P19783 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cox4i1P19783 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms