Protein–RNA interactions for Protein: P19123

Tnnc1, Troponin C, slow skeletal and cardiac muscles, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnc1P19123 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tnnc1P19123 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Tnnc1P19123 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Tnnc1P19123 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tnnc1P19123 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tnnc1P19123 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tnnc1P19123 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tnnc1P19123 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tnnc1P19123 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tnnc1P19123 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tnnc1P19123 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tnnc1P19123 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tnnc1P19123 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tnnc1P19123 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tnnc1P19123 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tnnc1P19123 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tnnc1P19123 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tnnc1P19123 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tnnc1P19123 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tnnc1P19123 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tnnc1P19123 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tnnc1P19123 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tnnc1P19123 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tnnc1P19123 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tnnc1P19123 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tnnc1P19123 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tnnc1P19123 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tnnc1P19123 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tnnc1P19123 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tnnc1P19123 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tnnc1P19123 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tnnc1P19123 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tnnc1P19123 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tnnc1P19123 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tnnc1P19123 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tnnc1P19123 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tnnc1P19123 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Tnnc1P19123 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Tnnc1P19123 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tnnc1P19123 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tnnc1P19123 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tnnc1P19123 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tnnc1P19123 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tnnc1P19123 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tnnc1P19123 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tnnc1P19123 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tnnc1P19123 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tnnc1P19123 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tnnc1P19123 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tnnc1P19123 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tnnc1P19123 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tnnc1P19123 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tnnc1P19123 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tnnc1P19123 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tnnc1P19123 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tnnc1P19123 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tnnc1P19123 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tnnc1P19123 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tnnc1P19123 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Tnnc1P19123 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tnnc1P19123 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Tnnc1P19123 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tnnc1P19123 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tnnc1P19123 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Tnnc1P19123 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tnnc1P19123 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tnnc1P19123 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tnnc1P19123 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tnnc1P19123 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tnnc1P19123 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tnnc1P19123 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tnnc1P19123 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tnnc1P19123 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tnnc1P19123 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tnnc1P19123 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tnnc1P19123 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tnnc1P19123 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tnnc1P19123 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tnnc1P19123 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tnnc1P19123 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tnnc1P19123 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tnnc1P19123 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Tnnc1P19123 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tnnc1P19123 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tnnc1P19123 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tnnc1P19123 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tnnc1P19123 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tnnc1P19123 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tnnc1P19123 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tnnc1P19123 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tnnc1P19123 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tnnc1P19123 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tnnc1P19123 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tnnc1P19123 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tnnc1P19123 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tnnc1P19123 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tnnc1P19123 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tnnc1P19123 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tnnc1P19123 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tnnc1P19123 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms