Protein–RNA interactions for Protein: P18911

Rarg, Retinoic acid receptor gamma, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RargP18911 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RargP18911 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RargP18911 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RargP18911 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RargP18911 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RargP18911 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RargP18911 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RargP18911 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RargP18911 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RargP18911 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
RargP18911 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RargP18911 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RargP18911 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RargP18911 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RargP18911 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RargP18911 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RargP18911 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RargP18911 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RargP18911 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RargP18911 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RargP18911 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RargP18911 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
RargP18911 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RargP18911 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RargP18911 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RargP18911 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RargP18911 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RargP18911 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RargP18911 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RargP18911 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RargP18911 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RargP18911 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RargP18911 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RargP18911 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RargP18911 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
RargP18911 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RargP18911 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RargP18911 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RargP18911 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RargP18911 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RargP18911 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RargP18911 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RargP18911 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RargP18911 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
RargP18911 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RargP18911 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RargP18911 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
RargP18911 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RargP18911 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RargP18911 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RargP18911 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RargP18911 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RargP18911 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RargP18911 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RargP18911 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RargP18911 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RargP18911 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RargP18911 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RargP18911 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RargP18911 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RargP18911 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RargP18911 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RargP18911 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RargP18911 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RargP18911 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RargP18911 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RargP18911 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RargP18911 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
RargP18911 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RargP18911 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RargP18911 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RargP18911 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RargP18911 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RargP18911 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RargP18911 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RargP18911 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RargP18911 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RargP18911 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RargP18911 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RargP18911 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RargP18911 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RargP18911 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RargP18911 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RargP18911 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RargP18911 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RargP18911 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RargP18911 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RargP18911 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RargP18911 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RargP18911 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RargP18911 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RargP18911 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RargP18911 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RargP18911 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RargP18911 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RargP18911 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RargP18911 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RargP18911 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RargP18911 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RargP18911 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms