Protein–RNA interactions for Protein: P15508

Sptb, Spectrin beta chain, erythrocytic, mousemouse

Predictions only

Length 2,128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SptbP15508 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SptbP15508 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SptbP15508 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SptbP15508 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SptbP15508 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SptbP15508 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SptbP15508 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SptbP15508 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SptbP15508 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SptbP15508 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SptbP15508 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SptbP15508 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SptbP15508 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SptbP15508 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SptbP15508 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SptbP15508 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SptbP15508 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SptbP15508 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SptbP15508 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SptbP15508 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SptbP15508 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SptbP15508 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SptbP15508 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SptbP15508 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SptbP15508 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SptbP15508 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SptbP15508 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SptbP15508 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SptbP15508 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SptbP15508 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SptbP15508 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SptbP15508 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SptbP15508 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SptbP15508 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SptbP15508 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SptbP15508 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SptbP15508 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SptbP15508 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SptbP15508 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SptbP15508 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SptbP15508 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SptbP15508 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SptbP15508 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SptbP15508 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SptbP15508 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SptbP15508 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SptbP15508 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SptbP15508 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SptbP15508 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SptbP15508 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SptbP15508 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SptbP15508 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SptbP15508 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SptbP15508 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SptbP15508 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SptbP15508 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SptbP15508 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SptbP15508 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SptbP15508 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SptbP15508 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SptbP15508 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SptbP15508 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SptbP15508 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SptbP15508 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SptbP15508 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SptbP15508 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SptbP15508 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SptbP15508 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SptbP15508 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SptbP15508 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SptbP15508 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SptbP15508 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SptbP15508 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SptbP15508 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SptbP15508 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SptbP15508 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SptbP15508 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SptbP15508 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SptbP15508 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SptbP15508 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SptbP15508 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SptbP15508 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SptbP15508 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SptbP15508 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SptbP15508 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SptbP15508 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SptbP15508 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SptbP15508 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SptbP15508 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SptbP15508 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SptbP15508 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SptbP15508 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SptbP15508 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SptbP15508 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SptbP15508 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SptbP15508 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SptbP15508 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SptbP15508 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SptbP15508 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SptbP15508 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms