Protein–RNA interactions for Protein: P10923

Spp1, Osteopontin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 294 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spp1P10923 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Spp1P10923 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Spp1P10923 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Spp1P10923 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Spp1P10923 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Spp1P10923 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Spp1P10923 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Spp1P10923 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Spp1P10923 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Spp1P10923 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Spp1P10923 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Spp1P10923 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Spp1P10923 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Spp1P10923 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Spp1P10923 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Spp1P10923 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Spp1P10923 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Spp1P10923 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Spp1P10923 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Spp1P10923 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Spp1P10923 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Spp1P10923 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Spp1P10923 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Spp1P10923 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Spp1P10923 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Spp1P10923 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Spp1P10923 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Spp1P10923 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Spp1P10923 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Spp1P10923 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Spp1P10923 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Spp1P10923 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Spp1P10923 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Spp1P10923 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Spp1P10923 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Spp1P10923 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Spp1P10923 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Spp1P10923 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Spp1P10923 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Spp1P10923 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Spp1P10923 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Spp1P10923 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Spp1P10923 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Spp1P10923 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Spp1P10923 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Spp1P10923 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Spp1P10923 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Spp1P10923 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Spp1P10923 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Spp1P10923 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Spp1P10923 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Spp1P10923 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Spp1P10923 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Spp1P10923 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Spp1P10923 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Spp1P10923 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Spp1P10923 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Spp1P10923 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Spp1P10923 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Spp1P10923 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Spp1P10923 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Spp1P10923 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Spp1P10923 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Spp1P10923 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Spp1P10923 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Spp1P10923 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Spp1P10923 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Spp1P10923 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Spp1P10923 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Spp1P10923 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Spp1P10923 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Spp1P10923 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Spp1P10923 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Spp1P10923 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Spp1P10923 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Spp1P10923 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Spp1P10923 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Spp1P10923 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Spp1P10923 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Spp1P10923 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Spp1P10923 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Spp1P10923 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Spp1P10923 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Spp1P10923 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Spp1P10923 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Spp1P10923 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Spp1P10923 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Spp1P10923 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Spp1P10923 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Spp1P10923 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Spp1P10923 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Spp1P10923 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Spp1P10923 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Spp1P10923 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Spp1P10923 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Spp1P10923 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Spp1P10923 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Spp1P10923 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Spp1P10923 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Spp1P10923 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms