Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

Predictions only

Length 641 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P10404 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P10404 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
P10404 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P10404 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P10404 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P10404 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P10404 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P10404 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P10404 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P10404 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P10404 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P10404 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P10404 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P10404 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P10404 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
P10404 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P10404 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P10404 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P10404 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P10404 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P10404 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P10404 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
P10404 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P10404 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P10404 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P10404 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
P10404 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
P10404 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
P10404 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
P10404 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P10404 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P10404 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
P10404 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P10404 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P10404 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P10404 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P10404 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P10404 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P10404 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P10404 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
P10404 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P10404 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P10404 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P10404 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P10404 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
P10404 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P10404 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
P10404 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P10404 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P10404 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
P10404 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P10404 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P10404 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
P10404 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
P10404 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P10404 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
P10404 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P10404 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
P10404 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P10404 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P10404 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P10404 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
P10404 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
P10404 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
P10404 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
P10404 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
P10404 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
P10404 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
P10404 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
P10404 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
P10404 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
P10404 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
P10404 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
P10404 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
P10404 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
P10404 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
P10404 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
P10404 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
P10404 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
P10404 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
P10404 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
P10404 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
P10404 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
P10404 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
P10404 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
P10404 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
P10404 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
P10404 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
P10404 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
P10404 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
P10404 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
P10404 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
P10404 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
P10404 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
P10404 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
P10404 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
P10404 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
P10404 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
P10404 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms