Protein–RNA interactions for Protein: P0DOY1

Dnmt3c, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3C, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt3cP0DOY1 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Dnmt3cP0DOY1 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Dnmt3cP0DOY1 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Dnmt3cP0DOY1 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Dnmt3cP0DOY1 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dnmt3cP0DOY1 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dnmt3cP0DOY1 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dnmt3cP0DOY1 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dnmt3cP0DOY1 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dnmt3cP0DOY1 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dnmt3cP0DOY1 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dnmt3cP0DOY1 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dnmt3cP0DOY1 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dnmt3cP0DOY1 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dnmt3cP0DOY1 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dnmt3cP0DOY1 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dnmt3cP0DOY1 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dnmt3cP0DOY1 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dnmt3cP0DOY1 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dnmt3cP0DOY1 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dnmt3cP0DOY1 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dnmt3cP0DOY1 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dnmt3cP0DOY1 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dnmt3cP0DOY1 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dnmt3cP0DOY1 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dnmt3cP0DOY1 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Dnmt3cP0DOY1 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dnmt3cP0DOY1 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Dnmt3cP0DOY1 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dnmt3cP0DOY1 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dnmt3cP0DOY1 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Dnmt3cP0DOY1 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dnmt3cP0DOY1 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dnmt3cP0DOY1 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dnmt3cP0DOY1 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dnmt3cP0DOY1 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dnmt3cP0DOY1 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dnmt3cP0DOY1 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dnmt3cP0DOY1 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dnmt3cP0DOY1 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dnmt3cP0DOY1 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dnmt3cP0DOY1 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dnmt3cP0DOY1 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dnmt3cP0DOY1 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Dnmt3cP0DOY1 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dnmt3cP0DOY1 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dnmt3cP0DOY1 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Dnmt3cP0DOY1 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dnmt3cP0DOY1 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dnmt3cP0DOY1 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dnmt3cP0DOY1 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dnmt3cP0DOY1 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dnmt3cP0DOY1 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dnmt3cP0DOY1 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dnmt3cP0DOY1 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dnmt3cP0DOY1 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dnmt3cP0DOY1 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dnmt3cP0DOY1 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dnmt3cP0DOY1 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Dnmt3cP0DOY1 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Dnmt3cP0DOY1 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Dnmt3cP0DOY1 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Dnmt3cP0DOY1 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Dnmt3cP0DOY1 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Dnmt3cP0DOY1 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Dnmt3cP0DOY1 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Dnmt3cP0DOY1 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Dnmt3cP0DOY1 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Dnmt3cP0DOY1 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Dnmt3cP0DOY1 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Dnmt3cP0DOY1 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Dnmt3cP0DOY1 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Dnmt3cP0DOY1 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Dnmt3cP0DOY1 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Dnmt3cP0DOY1 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Dnmt3cP0DOY1 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Dnmt3cP0DOY1 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Dnmt3cP0DOY1 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Dnmt3cP0DOY1 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Dnmt3cP0DOY1 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Dnmt3cP0DOY1 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Dnmt3cP0DOY1 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Dnmt3cP0DOY1 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Dnmt3cP0DOY1 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Dnmt3cP0DOY1 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Dnmt3cP0DOY1 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Dnmt3cP0DOY1 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Dnmt3cP0DOY1 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Dnmt3cP0DOY1 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Dnmt3cP0DOY1 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Dnmt3cP0DOY1 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Dnmt3cP0DOY1 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Dnmt3cP0DOY1 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Dnmt3cP0DOY1 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Dnmt3cP0DOY1 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Dnmt3cP0DOY1 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Dnmt3cP0DOY1 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Dnmt3cP0DOY1 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Dnmt3cP0DOY1 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Dnmt3cP0DOY1 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms