Protein–RNA interactions for Protein: P0C7L0

Wipf3, WAS/WASL-interacting protein family member 3, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wipf3P0C7L0 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Wipf3P0C7L0 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Wipf3P0C7L0 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Wipf3P0C7L0 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Wipf3P0C7L0 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Wipf3P0C7L0 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Wipf3P0C7L0 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Wipf3P0C7L0 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Wipf3P0C7L0 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Wipf3P0C7L0 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Wipf3P0C7L0 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Wipf3P0C7L0 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Wipf3P0C7L0 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Wipf3P0C7L0 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Wipf3P0C7L0 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Wipf3P0C7L0 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Wipf3P0C7L0 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Wipf3P0C7L0 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Wipf3P0C7L0 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Wipf3P0C7L0 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Wipf3P0C7L0 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Wipf3P0C7L0 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Wipf3P0C7L0 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Wipf3P0C7L0 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Wipf3P0C7L0 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Wipf3P0C7L0 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Wipf3P0C7L0 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Wipf3P0C7L0 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Wipf3P0C7L0 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Wipf3P0C7L0 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Wipf3P0C7L0 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Wipf3P0C7L0 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Wipf3P0C7L0 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Wipf3P0C7L0 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Wipf3P0C7L0 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Wipf3P0C7L0 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Wipf3P0C7L0 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Wipf3P0C7L0 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Wipf3P0C7L0 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Wipf3P0C7L0 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Wipf3P0C7L0 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Wipf3P0C7L0 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Wipf3P0C7L0 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Wipf3P0C7L0 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Wipf3P0C7L0 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Wipf3P0C7L0 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Wipf3P0C7L0 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Wipf3P0C7L0 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Wipf3P0C7L0 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Wipf3P0C7L0 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Wipf3P0C7L0 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Wipf3P0C7L0 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Wipf3P0C7L0 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Wipf3P0C7L0 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Wipf3P0C7L0 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Wipf3P0C7L0 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Wipf3P0C7L0 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Wipf3P0C7L0 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Wipf3P0C7L0 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Wipf3P0C7L0 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Wipf3P0C7L0 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Wipf3P0C7L0 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Wipf3P0C7L0 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Wipf3P0C7L0 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Wipf3P0C7L0 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Wipf3P0C7L0 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Wipf3P0C7L0 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Wipf3P0C7L0 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Wipf3P0C7L0 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Wipf3P0C7L0 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Wipf3P0C7L0 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Wipf3P0C7L0 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Wipf3P0C7L0 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Wipf3P0C7L0 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Wipf3P0C7L0 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Wipf3P0C7L0 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Wipf3P0C7L0 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Wipf3P0C7L0 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Wipf3P0C7L0 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Wipf3P0C7L0 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Wipf3P0C7L0 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Wipf3P0C7L0 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Wipf3P0C7L0 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Wipf3P0C7L0 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Wipf3P0C7L0 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Wipf3P0C7L0 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Wipf3P0C7L0 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Wipf3P0C7L0 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Wipf3P0C7L0 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Wipf3P0C7L0 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Wipf3P0C7L0 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Wipf3P0C7L0 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Wipf3P0C7L0 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Wipf3P0C7L0 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Wipf3P0C7L0 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Wipf3P0C7L0 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Wipf3P0C7L0 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Wipf3P0C7L0 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Wipf3P0C7L0 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Wipf3P0C7L0 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms