Protein–RNA interactions for Protein: P09092

Hoxa6, Homeobox protein Hox-A6, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa6P09092 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxa6P09092 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxa6P09092 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxa6P09092 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxa6P09092 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxa6P09092 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxa6P09092 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxa6P09092 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxa6P09092 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxa6P09092 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxa6P09092 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxa6P09092 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxa6P09092 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxa6P09092 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxa6P09092 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxa6P09092 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxa6P09092 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxa6P09092 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxa6P09092 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxa6P09092 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxa6P09092 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxa6P09092 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxa6P09092 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxa6P09092 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxa6P09092 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxa6P09092 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxa6P09092 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxa6P09092 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxa6P09092 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxa6P09092 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxa6P09092 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxa6P09092 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxa6P09092 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxa6P09092 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxa6P09092 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxa6P09092 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxa6P09092 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxa6P09092 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxa6P09092 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxa6P09092 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxa6P09092 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxa6P09092 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxa6P09092 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxa6P09092 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxa6P09092 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxa6P09092 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxa6P09092 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxa6P09092 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxa6P09092 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxa6P09092 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxa6P09092 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxa6P09092 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxa6P09092 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxa6P09092 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxa6P09092 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxa6P09092 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxa6P09092 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxa6P09092 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxa6P09092 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxa6P09092 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxa6P09092 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxa6P09092 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxa6P09092 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxa6P09092 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxa6P09092 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxa6P09092 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxa6P09092 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxa6P09092 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxa6P09092 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxa6P09092 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxa6P09092 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxa6P09092 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxa6P09092 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxa6P09092 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxa6P09092 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxa6P09092 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxa6P09092 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxa6P09092 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxa6P09092 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxa6P09092 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxa6P09092 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxa6P09092 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxa6P09092 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxa6P09092 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxa6P09092 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxa6P09092 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxa6P09092 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxa6P09092 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxa6P09092 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxa6P09092 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxa6P09092 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxa6P09092 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxa6P09092 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxa6P09092 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxa6P09092 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxa6P09092 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxa6P09092 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxa6P09092 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxa6P09092 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxa6P09092 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.2 ms