Protein–RNA interactions for Protein: P08553

Nefm, Neurofilament medium polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NefmP08553 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NefmP08553 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NefmP08553 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NefmP08553 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NefmP08553 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NefmP08553 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NefmP08553 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NefmP08553 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NefmP08553 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
NefmP08553 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
NefmP08553 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NefmP08553 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NefmP08553 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NefmP08553 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NefmP08553 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NefmP08553 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NefmP08553 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NefmP08553 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NefmP08553 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NefmP08553 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
NefmP08553 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NefmP08553 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NefmP08553 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NefmP08553 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NefmP08553 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NefmP08553 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NefmP08553 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NefmP08553 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NefmP08553 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NefmP08553 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NefmP08553 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NefmP08553 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NefmP08553 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NefmP08553 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NefmP08553 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NefmP08553 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NefmP08553 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NefmP08553 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NefmP08553 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NefmP08553 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NefmP08553 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NefmP08553 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NefmP08553 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NefmP08553 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NefmP08553 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NefmP08553 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NefmP08553 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NefmP08553 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NefmP08553 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NefmP08553 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NefmP08553 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NefmP08553 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NefmP08553 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NefmP08553 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NefmP08553 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
NefmP08553 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
NefmP08553 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NefmP08553 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NefmP08553 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NefmP08553 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NefmP08553 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NefmP08553 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NefmP08553 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NefmP08553 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NefmP08553 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NefmP08553 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NefmP08553 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
NefmP08553 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NefmP08553 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NefmP08553 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
NefmP08553 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NefmP08553 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NefmP08553 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NefmP08553 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NefmP08553 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NefmP08553 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NefmP08553 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NefmP08553 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NefmP08553 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NefmP08553 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NefmP08553 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NefmP08553 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NefmP08553 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NefmP08553 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NefmP08553 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NefmP08553 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NefmP08553 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NefmP08553 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NefmP08553 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NefmP08553 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NefmP08553 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
NefmP08553 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NefmP08553 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NefmP08553 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NefmP08553 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NefmP08553 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NefmP08553 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
NefmP08553 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
NefmP08553 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
NefmP08553 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms