Protein–RNA interactions for Protein: P08228

Sod1, Superoxide dismutase [Cu-Zn], mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 154 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sod1P08228 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sod1P08228 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sod1P08228 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sod1P08228 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sod1P08228 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sod1P08228 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sod1P08228 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sod1P08228 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sod1P08228 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sod1P08228 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sod1P08228 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sod1P08228 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sod1P08228 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sod1P08228 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sod1P08228 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Sod1P08228 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Sod1P08228 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sod1P08228 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sod1P08228 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Sod1P08228 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Sod1P08228 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sod1P08228 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sod1P08228 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sod1P08228 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sod1P08228 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sod1P08228 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sod1P08228 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Sod1P08228 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sod1P08228 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sod1P08228 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sod1P08228 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sod1P08228 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sod1P08228 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Sod1P08228 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sod1P08228 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sod1P08228 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sod1P08228 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sod1P08228 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sod1P08228 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sod1P08228 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sod1P08228 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sod1P08228 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Sod1P08228 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sod1P08228 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sod1P08228 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sod1P08228 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sod1P08228 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sod1P08228 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sod1P08228 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Sod1P08228 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sod1P08228 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sod1P08228 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sod1P08228 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sod1P08228 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Sod1P08228 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sod1P08228 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sod1P08228 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sod1P08228 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sod1P08228 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sod1P08228 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sod1P08228 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sod1P08228 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sod1P08228 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sod1P08228 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sod1P08228 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Sod1P08228 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sod1P08228 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sod1P08228 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sod1P08228 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sod1P08228 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sod1P08228 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sod1P08228 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sod1P08228 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Sod1P08228 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Sod1P08228 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Sod1P08228 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Sod1P08228 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sod1P08228 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Sod1P08228 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Sod1P08228 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Sod1P08228 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sod1P08228 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sod1P08228 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sod1P08228 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sod1P08228 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sod1P08228 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sod1P08228 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sod1P08228 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sod1P08228 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sod1P08228 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sod1P08228 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sod1P08228 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sod1P08228 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sod1P08228 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Sod1P08228 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sod1P08228 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sod1P08228 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sod1P08228 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sod1P08228 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sod1P08228 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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