Protein–RNA interactions for Protein: P08226

Apoe, Apolipoprotein E, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApoeP08226 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ApoeP08226 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ApoeP08226 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ApoeP08226 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ApoeP08226 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ApoeP08226 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ApoeP08226 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ApoeP08226 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ApoeP08226 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ApoeP08226 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ApoeP08226 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ApoeP08226 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ApoeP08226 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ApoeP08226 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ApoeP08226 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ApoeP08226 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ApoeP08226 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ApoeP08226 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ApoeP08226 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ApoeP08226 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ApoeP08226 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ApoeP08226 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ApoeP08226 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ApoeP08226 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ApoeP08226 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ApoeP08226 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ApoeP08226 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ApoeP08226 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ApoeP08226 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ApoeP08226 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ApoeP08226 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ApoeP08226 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ApoeP08226 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ApoeP08226 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ApoeP08226 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ApoeP08226 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ApoeP08226 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ApoeP08226 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ApoeP08226 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ApoeP08226 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ApoeP08226 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ApoeP08226 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ApoeP08226 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ApoeP08226 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ApoeP08226 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ApoeP08226 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ApoeP08226 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ApoeP08226 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ApoeP08226 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ApoeP08226 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ApoeP08226 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ApoeP08226 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ApoeP08226 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ApoeP08226 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ApoeP08226 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ApoeP08226 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ApoeP08226 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ApoeP08226 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ApoeP08226 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ApoeP08226 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ApoeP08226 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ApoeP08226 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ApoeP08226 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ApoeP08226 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ApoeP08226 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ApoeP08226 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ApoeP08226 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ApoeP08226 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ApoeP08226 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ApoeP08226 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ApoeP08226 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ApoeP08226 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ApoeP08226 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ApoeP08226 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ApoeP08226 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ApoeP08226 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ApoeP08226 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ApoeP08226 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ApoeP08226 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ApoeP08226 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ApoeP08226 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ApoeP08226 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ApoeP08226 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ApoeP08226 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ApoeP08226 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ApoeP08226 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ApoeP08226 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ApoeP08226 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ApoeP08226 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ApoeP08226 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ApoeP08226 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ApoeP08226 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ApoeP08226 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ApoeP08226 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ApoeP08226 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ApoeP08226 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ApoeP08226 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ApoeP08226 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ApoeP08226 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ApoeP08226 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms