Protein–RNA interactions for Protein: P06321

T-cell receptor beta chain V region A20.2.25, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P06321 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P06321 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P06321 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P06321 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
P06321 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P06321 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
P06321 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P06321 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P06321 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
P06321 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
P06321 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
P06321 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P06321 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
P06321 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
P06321 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P06321 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P06321 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P06321 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P06321 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
P06321 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
P06321 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P06321 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P06321 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P06321 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P06321 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
P06321 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P06321 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P06321 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
P06321 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
P06321 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
P06321 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P06321 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
P06321 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P06321 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
P06321 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P06321 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P06321 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P06321 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P06321 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P06321 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P06321 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
P06321 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
P06321 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
P06321 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P06321 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P06321 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
P06321 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
P06321 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P06321 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P06321 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
P06321 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
P06321 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
P06321 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P06321 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P06321 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P06321 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P06321 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
P06321 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P06321 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P06321 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P06321 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P06321 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P06321 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P06321 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P06321 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
P06321 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P06321 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P06321 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
P06321 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
P06321 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
P06321 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
P06321 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
P06321 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
P06321 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
P06321 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
P06321 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
P06321 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
P06321 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
P06321 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
P06321 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
P06321 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
P06321 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
P06321 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
P06321 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
P06321 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
P06321 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
P06321 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
P06321 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
P06321 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
P06321 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P06321 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
P06321 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P06321 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
P06321 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P06321 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P06321 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
P06321 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P06321 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P06321 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
P06321 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms