Protein–RNA interactions for Protein: P04213

T-cell receptor beta chain V region C5 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P04213 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P04213 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P04213 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
P04213 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P04213 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P04213 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P04213 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P04213 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
P04213 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P04213 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
P04213 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P04213 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P04213 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P04213 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
P04213 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P04213 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P04213 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P04213 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P04213 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P04213 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
P04213 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P04213 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
P04213 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P04213 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P04213 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P04213 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P04213 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
P04213 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P04213 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P04213 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P04213 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P04213 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P04213 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P04213 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
P04213 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
P04213 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
P04213 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P04213 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P04213 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P04213 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P04213 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P04213 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P04213 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
P04213 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P04213 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P04213 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P04213 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P04213 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P04213 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P04213 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
P04213 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
P04213 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P04213 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
P04213 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P04213 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P04213 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P04213 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
P04213 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P04213 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P04213 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P04213 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P04213 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P04213 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P04213 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P04213 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
P04213 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
P04213 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P04213 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
P04213 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P04213 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P04213 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P04213 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P04213 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P04213 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P04213 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
P04213 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
P04213 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P04213 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P04213 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P04213 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P04213 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P04213 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P04213 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P04213 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P04213 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P04213 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P04213 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
P04213 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
P04213 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
P04213 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
P04213 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
P04213 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
P04213 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
P04213 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
P04213 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
P04213 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
P04213 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
P04213 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
P04213 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
P04213 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms