Protein–RNA interactions for Protein: P02301

H3f3c, Histone H3.3C, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3f3cP02301 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
H3f3cP02301 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
H3f3cP02301 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
H3f3cP02301 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
H3f3cP02301 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
H3f3cP02301 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
H3f3cP02301 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
H3f3cP02301 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
H3f3cP02301 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
H3f3cP02301 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
H3f3cP02301 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
H3f3cP02301 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
H3f3cP02301 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
H3f3cP02301 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
H3f3cP02301 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
H3f3cP02301 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
H3f3cP02301 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
H3f3cP02301 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
H3f3cP02301 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
H3f3cP02301 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
H3f3cP02301 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
H3f3cP02301 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
H3f3cP02301 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
H3f3cP02301 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
H3f3cP02301 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
H3f3cP02301 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
H3f3cP02301 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
H3f3cP02301 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
H3f3cP02301 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
H3f3cP02301 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
H3f3cP02301 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
H3f3cP02301 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
H3f3cP02301 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
H3f3cP02301 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
H3f3cP02301 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
H3f3cP02301 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
H3f3cP02301 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
H3f3cP02301 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
H3f3cP02301 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
H3f3cP02301 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
H3f3cP02301 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
H3f3cP02301 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
H3f3cP02301 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
H3f3cP02301 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
H3f3cP02301 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
H3f3cP02301 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
H3f3cP02301 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
H3f3cP02301 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
H3f3cP02301 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
H3f3cP02301 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
H3f3cP02301 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
H3f3cP02301 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
H3f3cP02301 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
H3f3cP02301 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
H3f3cP02301 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
H3f3cP02301 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
H3f3cP02301 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
H3f3cP02301 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
H3f3cP02301 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
H3f3cP02301 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
H3f3cP02301 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
H3f3cP02301 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
H3f3cP02301 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
H3f3cP02301 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
H3f3cP02301 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
H3f3cP02301 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
H3f3cP02301 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
H3f3cP02301 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
H3f3cP02301 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
H3f3cP02301 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
H3f3cP02301 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
H3f3cP02301 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
H3f3cP02301 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
H3f3cP02301 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
H3f3cP02301 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
H3f3cP02301 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
H3f3cP02301 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
H3f3cP02301 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
H3f3cP02301 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
H3f3cP02301 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
H3f3cP02301 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
H3f3cP02301 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
H3f3cP02301 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
H3f3cP02301 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
H3f3cP02301 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
H3f3cP02301 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
H3f3cP02301 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
H3f3cP02301 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
H3f3cP02301 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
H3f3cP02301 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
H3f3cP02301 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
H3f3cP02301 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
H3f3cP02301 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
H3f3cP02301 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
H3f3cP02301 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
H3f3cP02301 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
H3f3cP02301 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
H3f3cP02301 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
H3f3cP02301 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
H3f3cP02301 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms