Protein–RNA interactions for Protein: P01942

Hba, Hemoglobin subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HbaP01942 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HbaP01942 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HbaP01942 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HbaP01942 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HbaP01942 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HbaP01942 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HbaP01942 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HbaP01942 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HbaP01942 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HbaP01942 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HbaP01942 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HbaP01942 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HbaP01942 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HbaP01942 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HbaP01942 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HbaP01942 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HbaP01942 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HbaP01942 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HbaP01942 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HbaP01942 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HbaP01942 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HbaP01942 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HbaP01942 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HbaP01942 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HbaP01942 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HbaP01942 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HbaP01942 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HbaP01942 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HbaP01942 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HbaP01942 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HbaP01942 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
HbaP01942 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HbaP01942 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HbaP01942 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HbaP01942 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HbaP01942 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HbaP01942 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HbaP01942 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HbaP01942 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HbaP01942 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HbaP01942 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HbaP01942 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HbaP01942 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HbaP01942 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HbaP01942 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HbaP01942 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HbaP01942 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HbaP01942 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HbaP01942 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HbaP01942 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HbaP01942 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HbaP01942 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HbaP01942 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
HbaP01942 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
HbaP01942 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HbaP01942 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HbaP01942 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HbaP01942 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HbaP01942 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HbaP01942 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HbaP01942 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HbaP01942 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HbaP01942 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HbaP01942 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HbaP01942 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HbaP01942 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HbaP01942 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HbaP01942 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HbaP01942 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HbaP01942 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HbaP01942 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HbaP01942 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HbaP01942 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HbaP01942 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HbaP01942 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HbaP01942 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HbaP01942 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HbaP01942 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HbaP01942 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HbaP01942 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HbaP01942 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HbaP01942 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HbaP01942 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HbaP01942 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HbaP01942 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HbaP01942 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HbaP01942 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HbaP01942 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.14
HbaP01942 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
HbaP01942 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
HbaP01942 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
HbaP01942 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
HbaP01942 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HbaP01942 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HbaP01942 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HbaP01942 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HbaP01942 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HbaP01942 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HbaP01942 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HbaP01942 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms