Protein–RNA interactions for Protein: P01822

Ig heavy chain V region MOPC 315, mousemouse

Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01822 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01822 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01822 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01822 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01822 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01822 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01822 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01822 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01822 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01822 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01822 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
P01822 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01822 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01822 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01822 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01822 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
P01822 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01822 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01822 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01822 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01822 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01822 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01822 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01822 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01822 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01822 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01822 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
P01822 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
P01822 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01822 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01822 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01822 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01822 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01822 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01822 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01822 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01822 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
P01822 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01822 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01822 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
P01822 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
P01822 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01822 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01822 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01822 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01822 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01822 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01822 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01822 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01822 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01822 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01822 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01822 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01822 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01822 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01822 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01822 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01822 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01822 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01822 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
P01822 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01822 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01822 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01822 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01822 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
P01822 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01822 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01822 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
P01822 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01822 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01822 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01822 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01822 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01822 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01822 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01822 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01822 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01822 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01822 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01822 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01822 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01822 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01822 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01822 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01822 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01822 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01822 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01822 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01822 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01822 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01822 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01822 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01822 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01822 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01822 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01822 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01822 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01822 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01822 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01822 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms