Protein–RNA interactions for Protein: P01810

Ig heavy chain V region J539, mousemouse

Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01810 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
P01810 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
P01810 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
P01810 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
P01810 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
P01810 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
P01810 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
P01810 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
P01810 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
P01810 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
P01810 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
P01810 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
P01810 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
P01810 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
P01810 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
P01810 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
P01810 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
P01810 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
P01810 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC17■□□□□ 0.31
P01810 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
P01810 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
P01810 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
P01810 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
P01810 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC17■□□□□ 0.31
P01810 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
P01810 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
P01810 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
P01810 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
P01810 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
P01810 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
P01810 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
P01810 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
P01810 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
P01810 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
P01810 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
P01810 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
P01810 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
P01810 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
P01810 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
P01810 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
P01810 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
P01810 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
P01810 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
P01810 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P01810 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P01810 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
P01810 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P01810 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P01810 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P01810 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P01810 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P01810 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
P01810 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P01810 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P01810 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P01810 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
P01810 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P01810 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P01810 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P01810 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P01810 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P01810 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
P01810 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
P01810 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
P01810 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
P01810 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
P01810 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
P01810 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
P01810 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
P01810 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
P01810 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
P01810 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
P01810 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
P01810 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
P01810 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
P01810 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
P01810 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
P01810 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
P01810 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
P01810 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
P01810 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
P01810 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
P01810 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
P01810 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
P01810 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
P01810 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
P01810 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
P01810 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
P01810 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
P01810 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
P01810 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
P01810 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
P01810 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
P01810 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
P01810 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
P01810 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
P01810 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
P01810 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
P01810 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
P01810 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms