Protein–RNA interactions for Protein: P01746

Ig heavy chain V region 93G7, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01746 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01746 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01746 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01746 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01746 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01746 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
P01746 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01746 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01746 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
P01746 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01746 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01746 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01746 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01746 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01746 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01746 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01746 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01746 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01746 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01746 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01746 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01746 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01746 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
P01746 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01746 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01746 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01746 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01746 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01746 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01746 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01746 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01746 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01746 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01746 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01746 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01746 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01746 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01746 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01746 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01746 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01746 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01746 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01746 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01746 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01746 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01746 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01746 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01746 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01746 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01746 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01746 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01746 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01746 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01746 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01746 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01746 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01746 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01746 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01746 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01746 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01746 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01746 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01746 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01746 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
P01746 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01746 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
P01746 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01746 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01746 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01746 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01746 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01746 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01746 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01746 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01746 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01746 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01746 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01746 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01746 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01746 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01746 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01746 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01746 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01746 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01746 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01746 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01746 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01746 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01746 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01746 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01746 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01746 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01746 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01746 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01746 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01746 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01746 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01746 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01746 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01746 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms