Protein–RNA interactions for Protein: P01735

T-cell receptor beta chain V region 86T1, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01735 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01735 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01735 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01735 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01735 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01735 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01735 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01735 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01735 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
P01735 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01735 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01735 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01735 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01735 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01735 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01735 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
P01735 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01735 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
P01735 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01735 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01735 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01735 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01735 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01735 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01735 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01735 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01735 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01735 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01735 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
P01735 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
P01735 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01735 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01735 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01735 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01735 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01735 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01735 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01735 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01735 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01735 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01735 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
P01735 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01735 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01735 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01735 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01735 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01735 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01735 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01735 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01735 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
P01735 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
P01735 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
P01735 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
P01735 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
P01735 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
P01735 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
P01735 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01735 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01735 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01735 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01735 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01735 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01735 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01735 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01735 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
P01735 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01735 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
P01735 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01735 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01735 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01735 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01735 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01735 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
P01735 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01735 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01735 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01735 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01735 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01735 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01735 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01735 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01735 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01735 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01735 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01735 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01735 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01735 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01735 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01735 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01735 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01735 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01735 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01735 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01735 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01735 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01735 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01735 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01735 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01735 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01735 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms