Protein–RNA interactions for Protein: P01669

Ig kappa chain V-III region PC 7769, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01669 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01669 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01669 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01669 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01669 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01669 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01669 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01669 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01669 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01669 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
P01669 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01669 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01669 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01669 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01669 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
P01669 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01669 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
P01669 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
P01669 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01669 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01669 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01669 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01669 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01669 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01669 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01669 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01669 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01669 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01669 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
P01669 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
P01669 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
P01669 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
P01669 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
P01669 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
P01669 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
P01669 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
P01669 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
P01669 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
P01669 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
P01669 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
P01669 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
P01669 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
P01669 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
P01669 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
P01669 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
P01669 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
P01669 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
P01669 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
P01669 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
P01669 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
P01669 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
P01669 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
P01669 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
P01669 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
P01669 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
P01669 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01669 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01669 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01669 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01669 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01669 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01669 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01669 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01669 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01669 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01669 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01669 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01669 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01669 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01669 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01669 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01669 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01669 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01669 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01669 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01669 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01669 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01669 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01669 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01669 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01669 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01669 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01669 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01669 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01669 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01669 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01669 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01669 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01669 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01669 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01669 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01669 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
P01669 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01669 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01669 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01669 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01669 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01669 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01669 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01669 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms