Protein–RNA interactions for Protein: P01629

Ig kappa chain V-II region 2S1.3, mousemouse

Predictions only

Length 112 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01629 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01629 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01629 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01629 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01629 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01629 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01629 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
P01629 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01629 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01629 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01629 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01629 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01629 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01629 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01629 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01629 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01629 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01629 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01629 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01629 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01629 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01629 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
P01629 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01629 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01629 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01629 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
P01629 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01629 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01629 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01629 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01629 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
P01629 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
P01629 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
P01629 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
P01629 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
P01629 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
P01629 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
P01629 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01629 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01629 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01629 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01629 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01629 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
P01629 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
P01629 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01629 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01629 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01629 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01629 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01629 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01629 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01629 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01629 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01629 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01629 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01629 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01629 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01629 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01629 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
P01629 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01629 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01629 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01629 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01629 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01629 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01629 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01629 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01629 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01629 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01629 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01629 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01629 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01629 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01629 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
P01629 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01629 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
P01629 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01629 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01629 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01629 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01629 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01629 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01629 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
P01629 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01629 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01629 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01629 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01629 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01629 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01629 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01629 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01629 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01629 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
P01629 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01629 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
P01629 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01629 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01629 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01629 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
P01629 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms