Protein–RNA interactions for Protein: O89026

Robo1, Roundabout homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Robo1O89026 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Robo1O89026 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Robo1O89026 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Robo1O89026 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Robo1O89026 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Robo1O89026 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Robo1O89026 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Robo1O89026 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Robo1O89026 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Robo1O89026 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Robo1O89026 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Robo1O89026 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Robo1O89026 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Robo1O89026 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Robo1O89026 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Robo1O89026 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Robo1O89026 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Robo1O89026 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Robo1O89026 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Robo1O89026 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Robo1O89026 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Robo1O89026 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Robo1O89026 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Robo1O89026 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Robo1O89026 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Robo1O89026 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Robo1O89026 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Robo1O89026 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Robo1O89026 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Robo1O89026 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Robo1O89026 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Robo1O89026 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Robo1O89026 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Robo1O89026 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Robo1O89026 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Robo1O89026 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Robo1O89026 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Robo1O89026 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Robo1O89026 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Robo1O89026 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Robo1O89026 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Robo1O89026 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Robo1O89026 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Robo1O89026 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Robo1O89026 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Robo1O89026 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Robo1O89026 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Robo1O89026 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Robo1O89026 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Robo1O89026 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Robo1O89026 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Robo1O89026 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Robo1O89026 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Robo1O89026 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Robo1O89026 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Robo1O89026 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Robo1O89026 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Robo1O89026 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Robo1O89026 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Robo1O89026 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Robo1O89026 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Robo1O89026 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Robo1O89026 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Robo1O89026 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Robo1O89026 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Robo1O89026 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Robo1O89026 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Robo1O89026 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Robo1O89026 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Robo1O89026 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Robo1O89026 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Robo1O89026 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Robo1O89026 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Robo1O89026 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Robo1O89026 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Robo1O89026 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Robo1O89026 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Robo1O89026 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Robo1O89026 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Robo1O89026 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Robo1O89026 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Robo1O89026 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Robo1O89026 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Robo1O89026 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Robo1O89026 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Robo1O89026 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Robo1O89026 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Robo1O89026 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Robo1O89026 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Robo1O89026 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Robo1O89026 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Robo1O89026 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Robo1O89026 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Robo1O89026 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Robo1O89026 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Robo1O89026 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Robo1O89026 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Robo1O89026 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Robo1O89026 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Robo1O89026 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms