Protein–RNA interactions for Protein: O88507

Cntfr, Ciliary neurotrophic factor receptor subunit alpha, mousemouse

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CntfrO88507 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CntfrO88507 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CntfrO88507 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CntfrO88507 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CntfrO88507 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CntfrO88507 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CntfrO88507 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CntfrO88507 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CntfrO88507 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CntfrO88507 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CntfrO88507 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CntfrO88507 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CntfrO88507 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CntfrO88507 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CntfrO88507 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CntfrO88507 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
CntfrO88507 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
CntfrO88507 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CntfrO88507 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CntfrO88507 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CntfrO88507 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CntfrO88507 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CntfrO88507 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CntfrO88507 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CntfrO88507 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CntfrO88507 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CntfrO88507 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CntfrO88507 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CntfrO88507 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CntfrO88507 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CntfrO88507 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CntfrO88507 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CntfrO88507 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CntfrO88507 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CntfrO88507 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CntfrO88507 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CntfrO88507 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CntfrO88507 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CntfrO88507 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CntfrO88507 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
CntfrO88507 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CntfrO88507 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CntfrO88507 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CntfrO88507 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CntfrO88507 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CntfrO88507 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CntfrO88507 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CntfrO88507 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CntfrO88507 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CntfrO88507 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CntfrO88507 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CntfrO88507 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
CntfrO88507 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CntfrO88507 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CntfrO88507 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CntfrO88507 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CntfrO88507 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
CntfrO88507 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CntfrO88507 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CntfrO88507 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CntfrO88507 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
CntfrO88507 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CntfrO88507 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CntfrO88507 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CntfrO88507 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CntfrO88507 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CntfrO88507 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CntfrO88507 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CntfrO88507 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CntfrO88507 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CntfrO88507 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CntfrO88507 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CntfrO88507 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CntfrO88507 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CntfrO88507 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
CntfrO88507 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CntfrO88507 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CntfrO88507 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CntfrO88507 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
CntfrO88507 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
CntfrO88507 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CntfrO88507 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
CntfrO88507 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
CntfrO88507 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CntfrO88507 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CntfrO88507 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CntfrO88507 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CntfrO88507 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CntfrO88507 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CntfrO88507 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CntfrO88507 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CntfrO88507 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CntfrO88507 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CntfrO88507 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CntfrO88507 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CntfrO88507 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CntfrO88507 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CntfrO88507 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CntfrO88507 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CntfrO88507 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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