Protein–RNA interactions for Protein: O88271

Cfdp1, Craniofacial development protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfdp1O88271 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Cfdp1O88271 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cfdp1O88271 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cfdp1O88271 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cfdp1O88271 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cfdp1O88271 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Cfdp1O88271 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cfdp1O88271 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cfdp1O88271 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cfdp1O88271 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cfdp1O88271 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cfdp1O88271 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cfdp1O88271 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cfdp1O88271 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cfdp1O88271 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cfdp1O88271 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cfdp1O88271 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cfdp1O88271 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cfdp1O88271 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cfdp1O88271 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cfdp1O88271 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cfdp1O88271 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cfdp1O88271 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cfdp1O88271 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cfdp1O88271 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cfdp1O88271 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cfdp1O88271 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cfdp1O88271 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cfdp1O88271 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cfdp1O88271 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cfdp1O88271 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cfdp1O88271 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cfdp1O88271 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cfdp1O88271 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cfdp1O88271 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cfdp1O88271 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cfdp1O88271 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cfdp1O88271 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cfdp1O88271 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cfdp1O88271 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Cfdp1O88271 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cfdp1O88271 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cfdp1O88271 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cfdp1O88271 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cfdp1O88271 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cfdp1O88271 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cfdp1O88271 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cfdp1O88271 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cfdp1O88271 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cfdp1O88271 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cfdp1O88271 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cfdp1O88271 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cfdp1O88271 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Cfdp1O88271 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cfdp1O88271 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cfdp1O88271 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cfdp1O88271 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cfdp1O88271 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cfdp1O88271 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cfdp1O88271 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cfdp1O88271 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cfdp1O88271 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cfdp1O88271 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cfdp1O88271 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cfdp1O88271 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cfdp1O88271 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cfdp1O88271 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cfdp1O88271 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cfdp1O88271 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cfdp1O88271 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cfdp1O88271 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cfdp1O88271 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cfdp1O88271 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cfdp1O88271 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cfdp1O88271 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cfdp1O88271 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cfdp1O88271 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cfdp1O88271 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cfdp1O88271 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cfdp1O88271 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cfdp1O88271 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cfdp1O88271 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cfdp1O88271 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cfdp1O88271 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cfdp1O88271 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cfdp1O88271 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cfdp1O88271 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cfdp1O88271 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cfdp1O88271 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cfdp1O88271 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cfdp1O88271 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cfdp1O88271 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cfdp1O88271 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cfdp1O88271 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cfdp1O88271 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cfdp1O88271 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cfdp1O88271 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cfdp1O88271 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cfdp1O88271 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cfdp1O88271 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms