Protein–RNA interactions for Protein: O70373

Xirp1, Xin actin-binding repeat-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xirp1O70373 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Xirp1O70373 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Xirp1O70373 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Xirp1O70373 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Xirp1O70373 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Xirp1O70373 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Xirp1O70373 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Xirp1O70373 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Xirp1O70373 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Xirp1O70373 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Xirp1O70373 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Xirp1O70373 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Xirp1O70373 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Xirp1O70373 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Xirp1O70373 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Xirp1O70373 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Xirp1O70373 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Xirp1O70373 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Xirp1O70373 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Xirp1O70373 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Xirp1O70373 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Xirp1O70373 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Xirp1O70373 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Xirp1O70373 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Xirp1O70373 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Xirp1O70373 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Xirp1O70373 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Xirp1O70373 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Xirp1O70373 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Xirp1O70373 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Xirp1O70373 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Xirp1O70373 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Xirp1O70373 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Xirp1O70373 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Xirp1O70373 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Xirp1O70373 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Xirp1O70373 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Xirp1O70373 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Xirp1O70373 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Xirp1O70373 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Xirp1O70373 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Xirp1O70373 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Xirp1O70373 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Xirp1O70373 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Xirp1O70373 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Xirp1O70373 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Xirp1O70373 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Xirp1O70373 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Xirp1O70373 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Xirp1O70373 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Xirp1O70373 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Xirp1O70373 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Xirp1O70373 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Xirp1O70373 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Xirp1O70373 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Xirp1O70373 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Xirp1O70373 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Xirp1O70373 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Xirp1O70373 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Xirp1O70373 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Xirp1O70373 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Xirp1O70373 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Xirp1O70373 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Xirp1O70373 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Xirp1O70373 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Xirp1O70373 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Xirp1O70373 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Xirp1O70373 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Xirp1O70373 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Xirp1O70373 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Xirp1O70373 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Xirp1O70373 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Xirp1O70373 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Xirp1O70373 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Xirp1O70373 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Xirp1O70373 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Xirp1O70373 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Xirp1O70373 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Xirp1O70373 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Xirp1O70373 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Xirp1O70373 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Xirp1O70373 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Xirp1O70373 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Xirp1O70373 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Xirp1O70373 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Xirp1O70373 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Xirp1O70373 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Xirp1O70373 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Xirp1O70373 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Xirp1O70373 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Xirp1O70373 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Xirp1O70373 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Xirp1O70373 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Xirp1O70373 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Xirp1O70373 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Xirp1O70373 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Xirp1O70373 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Xirp1O70373 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Xirp1O70373 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Xirp1O70373 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms