Protein–RNA interactions for Protein: O70174

Chrna4, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 629 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrna4O70174 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Chrna4O70174 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Chrna4O70174 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Chrna4O70174 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Chrna4O70174 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Chrna4O70174 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Chrna4O70174 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Chrna4O70174 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Chrna4O70174 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Chrna4O70174 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Chrna4O70174 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Chrna4O70174 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Chrna4O70174 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Chrna4O70174 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Chrna4O70174 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Chrna4O70174 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Chrna4O70174 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Chrna4O70174 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Chrna4O70174 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Chrna4O70174 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Chrna4O70174 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Chrna4O70174 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Chrna4O70174 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Chrna4O70174 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Chrna4O70174 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Chrna4O70174 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Chrna4O70174 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Chrna4O70174 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Chrna4O70174 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Chrna4O70174 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Chrna4O70174 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Chrna4O70174 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Chrna4O70174 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Chrna4O70174 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Chrna4O70174 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Chrna4O70174 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Chrna4O70174 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Chrna4O70174 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Chrna4O70174 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Chrna4O70174 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Chrna4O70174 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Chrna4O70174 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Chrna4O70174 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Chrna4O70174 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Chrna4O70174 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Chrna4O70174 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Chrna4O70174 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Chrna4O70174 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Chrna4O70174 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Chrna4O70174 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Chrna4O70174 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Chrna4O70174 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Chrna4O70174 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Chrna4O70174 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Chrna4O70174 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Chrna4O70174 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Chrna4O70174 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Chrna4O70174 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Chrna4O70174 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Chrna4O70174 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Chrna4O70174 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Chrna4O70174 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Chrna4O70174 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Chrna4O70174 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Chrna4O70174 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Chrna4O70174 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Chrna4O70174 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Chrna4O70174 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Chrna4O70174 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Chrna4O70174 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Chrna4O70174 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Chrna4O70174 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Chrna4O70174 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Chrna4O70174 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Chrna4O70174 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Chrna4O70174 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Chrna4O70174 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Chrna4O70174 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Chrna4O70174 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Chrna4O70174 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Chrna4O70174 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Chrna4O70174 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Chrna4O70174 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Chrna4O70174 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Chrna4O70174 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Chrna4O70174 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Chrna4O70174 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Chrna4O70174 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Chrna4O70174 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Chrna4O70174 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Chrna4O70174 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Chrna4O70174 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Chrna4O70174 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Chrna4O70174 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Chrna4O70174 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Chrna4O70174 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Chrna4O70174 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Chrna4O70174 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Chrna4O70174 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Chrna4O70174 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms