Protein–RNA interactions for Protein: O55126

Nipsnap2, Protein NipSnap homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap2O55126 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nipsnap2O55126 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nipsnap2O55126 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nipsnap2O55126 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Nipsnap2O55126 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nipsnap2O55126 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nipsnap2O55126 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Nipsnap2O55126 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nipsnap2O55126 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nipsnap2O55126 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nipsnap2O55126 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nipsnap2O55126 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nipsnap2O55126 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nipsnap2O55126 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nipsnap2O55126 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nipsnap2O55126 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nipsnap2O55126 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nipsnap2O55126 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nipsnap2O55126 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nipsnap2O55126 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nipsnap2O55126 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nipsnap2O55126 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nipsnap2O55126 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nipsnap2O55126 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nipsnap2O55126 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nipsnap2O55126 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nipsnap2O55126 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nipsnap2O55126 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nipsnap2O55126 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Nipsnap2O55126 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nipsnap2O55126 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nipsnap2O55126 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nipsnap2O55126 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nipsnap2O55126 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nipsnap2O55126 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nipsnap2O55126 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nipsnap2O55126 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nipsnap2O55126 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nipsnap2O55126 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nipsnap2O55126 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nipsnap2O55126 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nipsnap2O55126 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nipsnap2O55126 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nipsnap2O55126 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nipsnap2O55126 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Nipsnap2O55126 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nipsnap2O55126 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nipsnap2O55126 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nipsnap2O55126 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nipsnap2O55126 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Nipsnap2O55126 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nipsnap2O55126 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nipsnap2O55126 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nipsnap2O55126 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nipsnap2O55126 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nipsnap2O55126 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nipsnap2O55126 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nipsnap2O55126 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Nipsnap2O55126 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nipsnap2O55126 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nipsnap2O55126 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nipsnap2O55126 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nipsnap2O55126 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nipsnap2O55126 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nipsnap2O55126 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nipsnap2O55126 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nipsnap2O55126 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nipsnap2O55126 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nipsnap2O55126 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nipsnap2O55126 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nipsnap2O55126 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nipsnap2O55126 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nipsnap2O55126 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nipsnap2O55126 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nipsnap2O55126 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nipsnap2O55126 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nipsnap2O55126 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nipsnap2O55126 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nipsnap2O55126 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nipsnap2O55126 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nipsnap2O55126 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nipsnap2O55126 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nipsnap2O55126 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nipsnap2O55126 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nipsnap2O55126 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Nipsnap2O55126 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nipsnap2O55126 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nipsnap2O55126 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nipsnap2O55126 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nipsnap2O55126 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nipsnap2O55126 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nipsnap2O55126 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nipsnap2O55126 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nipsnap2O55126 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nipsnap2O55126 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nipsnap2O55126 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nipsnap2O55126 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Nipsnap2O55126 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nipsnap2O55126 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nipsnap2O55126 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms