Protein–RNA interactions for Protein: O55100

Syngr1, Synaptogyrin-1, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngr1O55100 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Syngr1O55100 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Syngr1O55100 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Syngr1O55100 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Syngr1O55100 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Syngr1O55100 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Syngr1O55100 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Syngr1O55100 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Syngr1O55100 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Syngr1O55100 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Syngr1O55100 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Syngr1O55100 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Syngr1O55100 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Syngr1O55100 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Syngr1O55100 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Syngr1O55100 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Syngr1O55100 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Syngr1O55100 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Syngr1O55100 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Syngr1O55100 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Syngr1O55100 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Syngr1O55100 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Syngr1O55100 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Syngr1O55100 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Syngr1O55100 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Syngr1O55100 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Syngr1O55100 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Syngr1O55100 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Syngr1O55100 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Syngr1O55100 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Syngr1O55100 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Syngr1O55100 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Syngr1O55100 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Syngr1O55100 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Syngr1O55100 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Syngr1O55100 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Syngr1O55100 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Syngr1O55100 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Syngr1O55100 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Syngr1O55100 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Syngr1O55100 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Syngr1O55100 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Syngr1O55100 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Syngr1O55100 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Syngr1O55100 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Syngr1O55100 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Syngr1O55100 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Syngr1O55100 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Syngr1O55100 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Syngr1O55100 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Syngr1O55100 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Syngr1O55100 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Syngr1O55100 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Syngr1O55100 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Syngr1O55100 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Syngr1O55100 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Syngr1O55100 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Syngr1O55100 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Syngr1O55100 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Syngr1O55100 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Syngr1O55100 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Syngr1O55100 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Syngr1O55100 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Syngr1O55100 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Syngr1O55100 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Syngr1O55100 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Syngr1O55100 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Syngr1O55100 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Syngr1O55100 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Syngr1O55100 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Syngr1O55100 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Syngr1O55100 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Syngr1O55100 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Syngr1O55100 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Syngr1O55100 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Syngr1O55100 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Syngr1O55100 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Syngr1O55100 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Syngr1O55100 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Syngr1O55100 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Syngr1O55100 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Syngr1O55100 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Syngr1O55100 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Syngr1O55100 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Syngr1O55100 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Syngr1O55100 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Syngr1O55100 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Syngr1O55100 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Syngr1O55100 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Syngr1O55100 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Syngr1O55100 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Syngr1O55100 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Syngr1O55100 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Syngr1O55100 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Syngr1O55100 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Syngr1O55100 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Syngr1O55100 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Syngr1O55100 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Syngr1O55100 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Syngr1O55100 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms