Protein–RNA interactions for Protein: O54957

Lat, Linker for activation of T-cells family member 1, mousemouse

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LatO54957 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LatO54957 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LatO54957 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LatO54957 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LatO54957 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LatO54957 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LatO54957 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LatO54957 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LatO54957 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LatO54957 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LatO54957 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LatO54957 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LatO54957 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LatO54957 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LatO54957 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LatO54957 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LatO54957 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LatO54957 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LatO54957 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LatO54957 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LatO54957 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LatO54957 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LatO54957 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LatO54957 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LatO54957 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LatO54957 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LatO54957 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LatO54957 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LatO54957 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LatO54957 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LatO54957 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LatO54957 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LatO54957 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LatO54957 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LatO54957 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LatO54957 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LatO54957 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LatO54957 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LatO54957 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
LatO54957 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LatO54957 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
LatO54957 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LatO54957 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LatO54957 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LatO54957 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LatO54957 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
LatO54957 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
LatO54957 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
LatO54957 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
LatO54957 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
LatO54957 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
LatO54957 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.19
LatO54957 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LatO54957 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LatO54957 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LatO54957 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LatO54957 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LatO54957 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
LatO54957 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LatO54957 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LatO54957 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LatO54957 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LatO54957 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LatO54957 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LatO54957 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LatO54957 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LatO54957 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LatO54957 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LatO54957 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LatO54957 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LatO54957 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LatO54957 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LatO54957 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LatO54957 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LatO54957 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LatO54957 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LatO54957 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LatO54957 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LatO54957 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LatO54957 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LatO54957 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LatO54957 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LatO54957 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LatO54957 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LatO54957 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LatO54957 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LatO54957 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LatO54957 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LatO54957 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LatO54957 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LatO54957 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LatO54957 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LatO54957 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LatO54957 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LatO54957 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LatO54957 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LatO54957 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LatO54957 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LatO54957 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LatO54957 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms