Protein–RNA interactions for Protein: O54890

Itgb3, Integrin beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 787 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb3O54890 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Itgb3O54890 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Itgb3O54890 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Itgb3O54890 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Itgb3O54890 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Itgb3O54890 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Itgb3O54890 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Itgb3O54890 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Itgb3O54890 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Itgb3O54890 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Itgb3O54890 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Itgb3O54890 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Itgb3O54890 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Itgb3O54890 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Itgb3O54890 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Itgb3O54890 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Itgb3O54890 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Itgb3O54890 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Itgb3O54890 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Itgb3O54890 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Itgb3O54890 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Itgb3O54890 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Itgb3O54890 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Itgb3O54890 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Itgb3O54890 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Itgb3O54890 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Itgb3O54890 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Itgb3O54890 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Itgb3O54890 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Itgb3O54890 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Itgb3O54890 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Itgb3O54890 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Itgb3O54890 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Itgb3O54890 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Itgb3O54890 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Itgb3O54890 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Itgb3O54890 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Itgb3O54890 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Itgb3O54890 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Itgb3O54890 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Itgb3O54890 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Itgb3O54890 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Itgb3O54890 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Itgb3O54890 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Itgb3O54890 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Itgb3O54890 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Itgb3O54890 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Itgb3O54890 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Itgb3O54890 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Itgb3O54890 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Itgb3O54890 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Itgb3O54890 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Itgb3O54890 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Itgb3O54890 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Itgb3O54890 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Itgb3O54890 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Itgb3O54890 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Itgb3O54890 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Itgb3O54890 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Itgb3O54890 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Itgb3O54890 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Itgb3O54890 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Itgb3O54890 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Itgb3O54890 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Itgb3O54890 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Itgb3O54890 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Itgb3O54890 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Itgb3O54890 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Itgb3O54890 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Itgb3O54890 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Itgb3O54890 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Itgb3O54890 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Itgb3O54890 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Itgb3O54890 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Itgb3O54890 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Itgb3O54890 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Itgb3O54890 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Itgb3O54890 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Itgb3O54890 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Itgb3O54890 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Itgb3O54890 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Itgb3O54890 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Itgb3O54890 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Itgb3O54890 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Itgb3O54890 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Itgb3O54890 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Itgb3O54890 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Itgb3O54890 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Itgb3O54890 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Itgb3O54890 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Itgb3O54890 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Itgb3O54890 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Itgb3O54890 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Itgb3O54890 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Itgb3O54890 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Itgb3O54890 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Itgb3O54890 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Itgb3O54890 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Itgb3O54890 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Itgb3O54890 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms