Protein–RNA interactions for Protein: O54827

Atp10a, Probable phospholipid-transporting ATPase VA, mousemouse

Predictions only

Length 1,508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp10aO54827 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Atp10aO54827 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Atp10aO54827 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Atp10aO54827 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Atp10aO54827 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Atp10aO54827 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Atp10aO54827 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Atp10aO54827 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Atp10aO54827 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Atp10aO54827 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Atp10aO54827 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Atp10aO54827 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Atp10aO54827 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Atp10aO54827 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Atp10aO54827 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Atp10aO54827 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Atp10aO54827 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Atp10aO54827 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Atp10aO54827 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Atp10aO54827 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Atp10aO54827 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Atp10aO54827 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Atp10aO54827 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Atp10aO54827 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Atp10aO54827 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Atp10aO54827 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Atp10aO54827 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Atp10aO54827 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Atp10aO54827 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Atp10aO54827 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Atp10aO54827 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Atp10aO54827 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Atp10aO54827 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Atp10aO54827 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Atp10aO54827 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Atp10aO54827 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Atp10aO54827 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Atp10aO54827 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Atp10aO54827 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Atp10aO54827 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Atp10aO54827 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Atp10aO54827 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Atp10aO54827 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Atp10aO54827 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Atp10aO54827 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Atp10aO54827 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Atp10aO54827 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Atp10aO54827 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Atp10aO54827 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Atp10aO54827 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Atp10aO54827 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Atp10aO54827 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Atp10aO54827 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Atp10aO54827 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Atp10aO54827 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Atp10aO54827 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Atp10aO54827 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Atp10aO54827 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Atp10aO54827 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Atp10aO54827 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Atp10aO54827 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Atp10aO54827 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Atp10aO54827 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Atp10aO54827 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Atp10aO54827 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Atp10aO54827 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Atp10aO54827 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Atp10aO54827 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Atp10aO54827 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Atp10aO54827 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Atp10aO54827 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Atp10aO54827 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Atp10aO54827 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Atp10aO54827 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Atp10aO54827 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Atp10aO54827 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Atp10aO54827 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Atp10aO54827 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Atp10aO54827 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Atp10aO54827 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Atp10aO54827 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Atp10aO54827 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Atp10aO54827 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Atp10aO54827 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Atp10aO54827 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Atp10aO54827 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Atp10aO54827 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Atp10aO54827 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Atp10aO54827 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Atp10aO54827 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Atp10aO54827 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Atp10aO54827 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Atp10aO54827 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Atp10aO54827 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Atp10aO54827 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Atp10aO54827 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Atp10aO54827 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Atp10aO54827 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Atp10aO54827 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Atp10aO54827 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.9 ms